高原高血压异常表达基因识别与检测模型构建
发布时间：2022-12-04 14:58
高血压疾病是一种在全球范围内都具有高发病率和高死亡率的疾病,目前是最常见的心脑血管疾病之一。20世纪90年代以来,高血压基因研究在世界范围内成为热点,其分子生物学研究主要是在特定人种中找到与原发性高血压相关的基因。除了遗传因素,环境因素对原发性高血压的发病也有关键影响。高原高血压作为高原地区特有的疾病,是环境、饮食和遗传等多种因素相互作用的结果,虽然目前对其发病机制仍在探索之中,但高原地区高寒缺氧的环境是诱发高原高血压的重要因素之一。长期生活在高原地区的人群为了适应高寒低氧的环境,基因和生理功能方面都发生了一定的适应性变化,其氧化应激水平也高于平原地区人群。近几年高通量微阵列杂交技术得到了快速的发展,尤其是基因芯片技术的广泛应用,产生了海量的基因表达谱数据。为对如此大规模的基因表达数据进行有效地组织和管理,各种数据库随之建立起来。因此,构建高血压疾病信息数据库有助于将高血压相关基因表达数据整合起来,针对性强,有助于生物学和医学工作者对高血压疾病的研究,这对高血压疾病的预防、诊断和治疗具有重要的科学意义和应用价值。本论文的重点是利用R编译环境构建差异表达基因识别与检测模型,以此模型为基础...
【文章页数】：55 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
中文摘要
Abstract
第一章 绪论
1.1 研究背景
1.2 国内外研究现状及意义
1.3 本文主要内容
1.4 本章小结
第二章R语言与生物信息学
2.1 生物信息学基础
2.1.1 基因组、转录组和蛋白质组
2.1.2 测序与序列分析
2.1.3 基因表达分析
2.1.4 生物信息数据库
2.2 R语言
2.3 Bioconductor
2.4 网页开发工具
2.5 本章小结
第三章 异常表达基因识别与检测构建
3.1 表达基因微阵列数据读取
3.2 基因表达数据的属性
3.3 微阵列数据预处理
3.3.1 背景处理
3.3.2 数据转换
3.3.3 缺失值填充
3.3.4 数据的标准化处理
3.4 差异表达基因筛选
3.5 聚类分析
3.6 本章小结
第四章 在线差异基因检测平台搭建
4.1 数据库构建方案
4.2 数据导入数据库
4.3 服务器与R通信
4.4 注释信息查询
4.5 差异基因筛选
4.6 本章小结
第五章 高血压相关差异表达基因识别
5.1 高血压相关基因表达数据
5.2 差异表达基因筛选
5.2.1 GDS2258数据集
5.2.2 GDS5083数据集
5.3 本章小结
第六章 结论与展望
6.1 论文工作总结
6.2 展望
参考文献
致谢
个人简历
攻读硕士学位期间的学术论文
【参考文献】：
期刊论文
[1]聚类分析算法在无线局域网优化分析中的应用[J]. 魏焕新. 科技创新与应用. 2017(06)
[2]贝那普利联合氨氯地平治疗原发性高血压患者的疗效观察[J]. 赵凤彦. 医疗装备. 2017(02)
[3]基于R语言的大数据处理平台的设计与实现[J]. 周芸韬. 现代电子技术. 2017(02)
[4]基因表达谱的非参缺失森林填补算法研究[J]. 吴小姣,李高明,易大莉,刘岭,张彦琦,易东,伍亚舟. 中国卫生统计. 2016(06)
[5]基因芯片在胃癌及肿瘤球细胞差异表达基因筛选中的应用[J]. 许乙威,贾举闻,简锋,许建平. 中国实用医药. 2016(30)
[6]基因芯片技术筛选转SlNAC1基因拟南芥差异表达基因[J]. 于静洋,李倩倩,焦杨,李秋莉. 生物工程学报. 2017(01)
[7]基于基因表达数据双向聚类算法的研究[J]. 王志玲,王化琨,李晓松,谷芳,周影,马维军. 黑龙江大学自然科学学报. 2016(04)
[8]以基因芯片探究针刺泻法对应激性高血压前期大鼠肾脏基因表达的影响[J]. 纪智,郭文,朱华超,谢晓佳,孙启胜,刘清国. 长春中医药大学学报. 2016(03)
[9]原发性高血压病因、危险因素及治疗研究进展[J]. 高金钗,彭伟. 河北北方学院学报(自然科学版). 2016(02)
[10]Ajax技术在网站开发中的应用研究[J]. 王建国. 湖南城市学院学报(自然科学版). 2016(01)
博士论文
[1]内皮型一氧化氮合酶基因多态性与原发性高血压发病相关性的研究[D]. 刘永生.吉林大学 2014
[2]基因表达数据分析方法及其应用研究[D]. 吴佳楠.吉林大学 2013
硕士论文
[1]基因芯片分析急性心肌梗死与稳定型心绞痛患者外周血差异基因表达谱[D]. 郑广.吉林大学 2016
[2]粒子群算法在基因表达数据聚类分析中的研究与应用[D]. 陈龙.湖南大学 2016
[3]基于基因表达微阵列数据集的加权双向聚类算法研究[D]. 王志玲.黑龙江大学 2016
[4]Web系统下提高MySQL数据库安全性的研究与实现[D]. 胡敏.北京邮电大学 2015
[5]高原高血压中医证候聚类分析研究[D]. 高傲.北京中医药大学 2014
[6]基于基因芯片的基因表达模式分析[D]. 王玉鹏.厦门大学 2007
本文编号：3708477
【文章页数】：55 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
中文摘要
Abstract
第一章 绪论
1.1 研究背景
1.2 国内外研究现状及意义
1.3 本文主要内容
1.4 本章小结
第二章R语言与生物信息学
2.1 生物信息学基础
2.1.1 基因组、转录组和蛋白质组
2.1.2 测序与序列分析
2.1.3 基因表达分析
2.1.4 生物信息数据库
2.2 R语言
2.3 Bioconductor
2.4 网页开发工具
2.5 本章小结
第三章 异常表达基因识别与检测构建
3.1 表达基因微阵列数据读取
3.2 基因表达数据的属性
3.3 微阵列数据预处理
3.3.1 背景处理
3.3.2 数据转换
3.3.3 缺失值填充
3.3.4 数据的标准化处理
3.4 差异表达基因筛选
3.5 聚类分析
3.6 本章小结
第四章 在线差异基因检测平台搭建
4.1 数据库构建方案
4.2 数据导入数据库
4.3 服务器与R通信
4.4 注释信息查询
4.5 差异基因筛选
4.6 本章小结
第五章 高血压相关差异表达基因识别
5.1 高血压相关基因表达数据
5.2 差异表达基因筛选
5.2.1 GDS2258数据集
5.2.2 GDS5083数据集
5.3 本章小结
第六章 结论与展望
6.1 论文工作总结
6.2 展望
参考文献
致谢
个人简历
攻读硕士学位期间的学术论文
【参考文献】：
期刊论文
[1]聚类分析算法在无线局域网优化分析中的应用[J]. 魏焕新. 科技创新与应用. 2017(06)
[2]贝那普利联合氨氯地平治疗原发性高血压患者的疗效观察[J]. 赵凤彦. 医疗装备. 2017(02)
[3]基于R语言的大数据处理平台的设计与实现[J]. 周芸韬. 现代电子技术. 2017(02)
[4]基因表达谱的非参缺失森林填补算法研究[J]. 吴小姣,李高明,易大莉,刘岭,张彦琦,易东,伍亚舟. 中国卫生统计. 2016(06)
[5]基因芯片在胃癌及肿瘤球细胞差异表达基因筛选中的应用[J]. 许乙威,贾举闻,简锋,许建平. 中国实用医药. 2016(30)
[6]基因芯片技术筛选转SlNAC1基因拟南芥差异表达基因[J]. 于静洋,李倩倩,焦杨,李秋莉. 生物工程学报. 2017(01)
[7]基于基因表达数据双向聚类算法的研究[J]. 王志玲,王化琨,李晓松,谷芳,周影,马维军. 黑龙江大学自然科学学报. 2016(04)
[8]以基因芯片探究针刺泻法对应激性高血压前期大鼠肾脏基因表达的影响[J]. 纪智,郭文,朱华超,谢晓佳,孙启胜,刘清国. 长春中医药大学学报. 2016(03)
[9]原发性高血压病因、危险因素及治疗研究进展[J]. 高金钗,彭伟. 河北北方学院学报(自然科学版). 2016(02)
[10]Ajax技术在网站开发中的应用研究[J]. 王建国. 湖南城市学院学报(自然科学版). 2016(01)
博士论文
[1]内皮型一氧化氮合酶基因多态性与原发性高血压发病相关性的研究[D]. 刘永生.吉林大学 2014
[2]基因表达数据分析方法及其应用研究[D]. 吴佳楠.吉林大学 2013
硕士论文
[1]基因芯片分析急性心肌梗死与稳定型心绞痛患者外周血差异基因表达谱[D]. 郑广.吉林大学 2016
[2]粒子群算法在基因表达数据聚类分析中的研究与应用[D]. 陈龙.湖南大学 2016
[3]基于基因表达微阵列数据集的加权双向聚类算法研究[D]. 王志玲.黑龙江大学 2016
[4]Web系统下提高MySQL数据库安全性的研究与实现[D]. 胡敏.北京邮电大学 2015
[5]高原高血压中医证候聚类分析研究[D]. 高傲.北京中医药大学 2014
[6]基于基因芯片的基因表达模式分析[D]. 王玉鹏.厦门大学 2007
本文编号：3708477
本文链接：https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3708477.html
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