基于肿瘤基质评分的胃癌预后基因分析

发布时间：2022-12-05 06:13

　　目的分析比较不同肿瘤基质评分胃癌患者的基因表达特征,鉴定与评分相关的胃癌预后基因,以期为临床胃癌诊断和预后提供更精准的手段。方法从癌症基因组图谱数据库（the cancer genome atals, TCGA）下载胃癌的临床资料和组织转录组测序（ribonucleic acid sequencing, RNAseq）表达数据。从基质免疫评估数据库（estimation of stromal and immune cells in malignant tumor tissues using expression data, ESTIMATE）网站下载TCGA数据库中胃癌患者基质评分信息。获取患者的临床信息、RNAseq表达谱、基质评分。按照基质评分的高低分为高基质评分组和低基质评分组,分析基质评分与胃癌预后的关系。用R语言DEseq2包进行标准化处理和差异分析;WGCNA（weight correlation network analysis, WGCNA）包筛选与基质评分密切相关的差异基因;单因素COX风险比例回归模型（COX proportional model, COX）初步筛选... 

【文章页数】：8 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 数据提取
    1.2 观察基质评分与预后的关系
    1.3 差异表达和共表达网络
    1.4 基因功能和基因临床模型的构建
    1.5 外部数据库验证
    1.6 统计学处理
2 结 果
    2.1 基质评分和患者预后的相关性分析
    2.2 与胃癌患者基质评分密切相关的基因筛查分析
    2.3 胃癌预后相关基因的筛选,及临床预测模型的构建
    2.4 临床预测模型的大数据验证
3 讨 论


【参考文献】：
期刊论文
[1]术前血清前白蛋白水平与直肠癌NOSES术后住院时间的相关性[J]. 李雪冬,傅传刚,杜涛,韩俊毅,鲁兵,周主青.  同济大学学报(医学版). 2019(06)
[2]多变量回归模型分析应用概述[J]. 于石成,亓晓,胡跃华,郑文静,王琦琦,么鸿雁.  中华预防医学杂志. 2019 (03)



本文编号：3709846