小麦PIN基因家族的鉴定及表达分析

发布时间：2022-12-06 19:59

　　【目的】PIN（puroindoline）是植物所特有的一类蛋白家族,对控制小麦籽粒硬度有重要功能。分析小麦PIN家族成员在全基因组的分布、结构及进化,研究其在不同组织的表达特异性以及在不同硬度种子的表达模式,为阐明小麦PIN基因家族的生物学功能奠定基础。【方法】根据已报道的小麦PIN基因和大麦HIN基因,利用BLASTP和HMM方法,在最新发布的小麦中国春参考序列中鉴定小麦PIN基因家族成员。利用UniProt、URGI、PFAM、CDD、expVIP等数据库,采用Clustal X、MEGA 7.0、ExPASy、MEME、GSDS、TB tools、GraphPad Prism5等软件进行生物信息学分析。采用qRT-PCR方法检测TaPIN基因家族在不同籽粒硬度小麦样品中的表达情况。【结果】共鉴定出19个小麦PIN基因,集中成簇分布于第1、5和7染色体同源群,编码148—327个氨基酸,编码蛋白相对分子量为16.39—37.19 kD,等电点为6.35—9.34。通过结构域和系统发育分析,可将19个TaPIN基因分为A和B两大类。大部分TaPINs基因仅有1个外显子,没有内含子,... 

【文章页数】：10 页

【文章目录】：
0 引言
1 材料与方法
    1.1 试验材料和处理方法
    1.2 小麦PIN基因家族的鉴定和系统发育分析
    1.3 小麦PIN基因的序列分析
    1.4 小麦PIN基因的表达分析
2 结果
    2.1 小麦PIN基因的鉴定和序列分析
    2.2 小麦PIN基因的系统发育分析、蛋白保守结构域及基因结构分析
    2.3 小麦PIN基因在不同组织、不同时期的表达分析
    2.4 小麦PIN基因在不同硬度小麦中的相对表达分析
3 讨论
4 结论


【参考文献】：
期刊论文
[1]小麦puroindoline及其相关基因分子遗传基础研究进展[J]. 陈锋,董中东,程西永,詹克慧,许海霞,崔党群.  中国农业科学. 2010(06)
[2]氮、钾及其互作对两种质型小麦品质性状的影响[J]. 李友军,熊瑛,骆炳山.  干旱地区农业研究. 2006(02)
[3]施氮量对小麦籽粒蛋白质组分含量及加工品质的影响[J]. 王月福,于振文,李尚霞,余松烈.  中国农业科学. 2002(09)



本文编号：3711543