十字花科MADS-box基因家族系统进化分析

发布时间：2022-12-07 01:32

　　MADS-box基因家族是一类特异识别结合[CArG]（A-rich）DNA特征序列的转录因子家族;在植物中参与调节包括植物花、果、叶、根的发育在内的多个重要的植物发育过程;此类基因在高等植物中大量存在,仅在拟南芥中就存在109个MADS-box基因。对于这一家族的起源进化分析已经积累相当丰硕的成果;比如这一家族起源于一次发生在真核生物祖先形成前的拓扑异构酶Ⅱ的A亚基复制加倍且经历另一次早期真核祖先中的基因加倍分化出了 SRF和MEF2两类基因的祖先。然而,前人的分析多集中在远源进化;其近源的分析少有人做,本研究欲丰富这一不足,聚焦于十字花科植物,以期揭示MADS-box基因家族的十字花科科内进化史。本研究首先分析了目前的27个已测序十字花科物种测序质量并结合现行十字花科植物分类系统确定有代表性的16个物种作为样本,并选取十字花科植物最近源的7个已测序物种作为外类群。之后,对16个样本植物进行了 MADS-box基因检测鉴定,得到了 2168个基因;最后,对这些基因进行了逐层深入的系统发育分析。研究结果表明,在现存十字花科早期共同祖先中至少存在50个MADS-box基因——19个tYy... 

【文章页数】：50 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
Abstract
1 绪论
    1.1 十字花科植物简介
    1.2 生物学中的系统发育分析
    1.3 MADS-box基因家族简介
    1.4 MADS蛋白的结构和细胞定位
    1.5 MADS蛋白的功能
    1.6 MADS-box家族进化分析进展
2 材料与方法
    2.1 生物信息学工具
    2.2 选材并获取数据
    2.3 MADS基因预测
    2.4 序列比对和进化树绘制
3 结果与分析
    3.1 MADS-box全家族进化分析
    3.2 TypeⅠ基因及其三个亚类的进化分析
    3.3 TypeⅡ基因整体进化分析
    3.4 TypeⅡ基因逐亚类分析
    3.5 总结
    3.6 讨论
参考文献
附录A Type I在十字花科中的分布统计
致谢


【参考文献】：
期刊论文
[1]拟南芥和琴叶拟南芥中MADS-box基因的比较进化分析[J]. 薛皓月,徐桂霞,国春策,山红艳,孔宏智.  生物多样性. 2010(02)



本文编号：3711993