利用全基因组关联分析法挖掘水稻核心种质优异耐冷耐铝基因

发布时间：2022-12-10 14:21

　　“丁氏”核心种质（150份）具有丰富遗传变异,对于水稻非生物胁迫（铝毒和冷害）研究具有重要价值。本研究对群体进行全基因组简化测序,分析其结构分层与遗传关系;并结合耐铝表型数据（相对根长）与耐冷表型数据（死苗率）对核心种质群体进行抗逆性的全基因组关联分析（GWAS）（混合线性模型）,挖掘及验证水稻核心种质中优异抗逆基因。研究结果简述如下:（1）SLAF-seq测序标记的高密度SNP位点,群体结构分析结果显示群体分为2-4个亚群。采用GWAS方法,鉴定到153个与耐铝显著关联的SNP位点,并定位30个与耐铝相关的QTL,其中6个QTL与前人研究结果共定位。进一步对具有较高显著性SNP位点（qALT3.2、qALT3.3、qALT3.4、qALT3.5,qALT1.2、qALT1.5、qALT2.3、qALT3.6、qALT3.7、qALT4.1、qALT6.1,和qALT9.1）所在QTL区域的候选基因进行RT-PCR检测、基因注释分析、氨基酸序列分析以及表达谱分析的多重筛选,最终定位到两个与耐铝相关的新基因（Os03g0437200与Os01g0304100）,对这两个基因的功能验证有待... 

【文章页数】：92 页

【学位级别】：博士

【部分图文】：

世界水稻产量与消耗量变化预测

植物低温应答的基因调控网络Figure1-2Networksofplantcold-responsivegeneregulatory本图引用肖宁等.2016

水稻耐冷性相关QTLFigure1-3QTLrelatedtocoldtoleranceinrice

【参考文献】：
期刊论文
[1]玉米早熟核心种质绥系709的选育与创新思考[J]. 石运强,南元涛,魏国才,金振国,高利,孙艳杰,邵勇,杨宾山,史淑春.  黑龙江农业科学. 2017(09)
[2]水稻耐冷QTL定位以及分子机理研究进展[J]. 肖宁,李育红,王志平,戴正元,黄年生,潘存红,张小祥,周长海,吴云雨,余玲,钱熀俊,陈建民,李爱宏.  分子植物育种. 2016(07)
[3]基于基因组学的作物种质资源研究:现状与展望[J]. 黎裕,李英慧,杨庆文,张锦鹏,张金梅,邱丽娟,王天宇.  中国农业科学. 2015(17)
[4]铝和酸胁迫对苜蓿根瘤菌生长和抗氧化酶系的影响[J]. 李智燕,邢学峰,唐华,尹亚丽,郭彦军.  草业学报. 2013(03)
[5]水稻种质资源基础性工作研究进展[J]. 韩龙植.  植物遗传资源学报. 2013(01)
[6]水稻核心种质表型性状遗传多样性分析及综合评价[J]. 胡标林,万勇,李霞,雷建国,罗向东,严文贵,谢建坤.  作物学报. 2012(05)
[7]中国栽培大豆（Glycine max （L.） Merr.）微核心种质的群体结构与遗传多样性[J]. 宋喜娥,李英慧,常汝镇,郭平毅,邱丽娟.  中国农业科学. 2010(11)
[8]栽培稻与高州普通野生稻耐铝性的比较研究[J]. 傅雪琳,陈伟栋,盘春辉,冯俊豪,刘向东,卢永根.  中国农业科学. 2010(04)
[9]茶陵野生稻苗期耐冷性研究[J]. 徐孟亮,陈志,肖媛,崔延春,徐国云,夏新界.  激光生物学报. 2009(06)
[10]水稻核心种质的构建策略研究[J]. 李晓玲,李金泉,卢永根.  沈阳农业大学学报. 2007(05)

博士论文
[1]水稻抽穗期的全基因组关联分析和叶色突变体pgl3的基因克隆[D]. 叶靖.沈阳农业大学 2018
[2]基于表达谱芯片和新一代测序技术的高通量基因分型方法的开发[D]. 谢为博.华中农业大学 2010
[3]中国水稻微核心种质的关联分析研究[D]. 闻玮玮.华中农业大学 2009

硕士论文
[1]黑龙江省水稻骨干亲本对衍生品种的遗传贡献及孕穗期耐冷性的关联分析[D]. 王允祥.东北农业大学 2017
[2]水稻核心种质抗倒特性及其主要农艺性状的全基因组关联分析[D]. 姚玉莹.华中农业大学 2014



本文编号：3716906