枣ATP1基因克隆及其在雄性可育和不育品种中的表达分析
发布时间:2022-12-11 11:20
以枣树雄性不育材料JMS1及雄性可育品种‘月光’及花粉中度可育品种‘冬枣’为试材,克隆ATP1基因,并比较其在枣雄性可育和不育材料之间的表达差异。枣ATP1基因包含完整开放阅读框为1 530bp,其编码蛋白与苹果和西瓜同源蛋白相似性系数分别达95.88%和98.62%。ATP1基因在3个品种中不存在碱基差异,且确定该基因为线粒体基因。利用实时荧光定量PCR技术检测ATP1基因组织特异表达发现,JMS1的嫩枝、老枝、叶、蕾中ATP1基因的表达量较高,但在花、花药、花萼、子房中,JMS1的ATP1基因表达量均低于‘月光’。在单花发育前期JMS1中ATP1表达量高于‘月光’和‘冬枣’,在单花发育后期其表达量低于‘月光’,但高于‘冬枣’。枣花蕾发育早期ATP1基因异常高表达可能影响了ATP合酶的合成,可能与JMS1花粉完全败育的主要原因有关。
【文章页数】:6 页
【文章目录】:
1 材料与方法
1.1 试验材料
1.2 方法
1.2.1 总RNA的提取及cDNA反转录
1.2.2 ATP1基因克隆
1.2.3 枣ATP1基因的生物信息学分析
1.2.4 枣ATP1基因组织特异性表达分析
1.2.5 枣ATP1基因在花发育不同阶段的表达分析
1.3 数据分析
2 结果与分析
2.1 ATP1基因的克隆及序列分析
2.2 ATP1基因的蛋白分析
2.2.1 ATP1基因蛋白结构和特征分析
2.2.2 ATP1蛋白亲疏水性、亚细胞定位及跨膜区预测
2.2.3 ATP1蛋白质二级结构预测
2.3 ATP1蛋白系统进化树分析
2.4 ATP1基因的组织特异性表达分析
2.5 ATP1基因在枣花不同发育阶段的表达分析
3 讨论与结论
【参考文献】:
期刊论文
[1]烟草ATP合酶F0部分4个亚基基因转录本编辑位点分析[J]. 陶瑶,王瑜,钟思荣,吴凌敏,谢丽娟,聂亚平,周玮,王建革,刘齐元. 作物学报. 2016(12)
[2]枣树雄性不育种质控制杂交的育性及杂种的SSR分子鉴定[J]. 孙学超,王玖瑞,代丽,赵锦,刘孟军. 河北农业大学学报. 2015(05)
[3]atp1基因在小麦BNS雄性不育系和自身转换系中的差异表达[J]. 赵大华,孙慧慧,于同英,李友勇. 生命科学研究. 2014(06)
[4]枣树免去雄杂交育种的设计与实践[J]. 刘孟军,王玖瑞,刘平,林敏娟,肖京,刘志国,孙学超. 园艺学报. 2014(07)
[5]红麻质核互作型雄性不育相关基因atp1的克隆与分析[J]. 陈艳翠,黄思齐,李建军,唐慧娟,陈安国,李德芳. 中国麻业科学. 2013(02)
[6]不结球白菜Pol胞质雄性不育系和保持系蕾期基因的差异表达[J]. 张昌伟,张蜀宁,侯喜林,齐莉,孙菲菲. 西北植物学报. 2010(08)
[7]3个南方枣品种花粉育性与花粉形态的观察[J]. 唐宁浩,何钢,李樊,赵思东,刘贤桂. 经济林研究. 2009(04)
[8]苎麻线粒体基因CoxⅡ和atpA与细胞质雄性不育相关性分析[J]. 段继强,李建永,杜光辉,梁雪妮,刘飞虎. 中国农业科学. 2009(02)
[9]10个线粒体基因在甘蓝型油菜NCa不育系统不同组织中的转录调控及其与育性的关系(英文)[J]. 危文亮,王汉中,刘贵华. 遗传学报. 2007(01)
[10]植物花粉发育的分子生物学研究进展[J]. 刘乐承,张弢,曹家树. 长江大学学报(自科版)农学卷. 2006(03)
博士论文
[1]红麻atp9、atp6、atpA基因克隆、功能分析与分子标签发掘[D]. 赵艳红.广西大学 2014
[2]白菜两种胞质雄性不育系及其保持系蕾期基因表达差异分析及相关基因克隆[D]. 蒋明.浙江大学 2007
硕士论文
[1]红麻质核互作型雄性不育相关基因atp1的克隆和表达分析[D]. 陈艳翠.中国农业科学院 2013
本文编号:3718688
【文章页数】:6 页
【文章目录】:
1 材料与方法
1.1 试验材料
1.2 方法
1.2.1 总RNA的提取及cDNA反转录
1.2.2 ATP1基因克隆
1.2.3 枣ATP1基因的生物信息学分析
1.2.4 枣ATP1基因组织特异性表达分析
1.2.5 枣ATP1基因在花发育不同阶段的表达分析
1.3 数据分析
2 结果与分析
2.1 ATP1基因的克隆及序列分析
2.2 ATP1基因的蛋白分析
2.2.1 ATP1基因蛋白结构和特征分析
2.2.2 ATP1蛋白亲疏水性、亚细胞定位及跨膜区预测
2.2.3 ATP1蛋白质二级结构预测
2.3 ATP1蛋白系统进化树分析
2.4 ATP1基因的组织特异性表达分析
2.5 ATP1基因在枣花不同发育阶段的表达分析
3 讨论与结论
【参考文献】:
期刊论文
[1]烟草ATP合酶F0部分4个亚基基因转录本编辑位点分析[J]. 陶瑶,王瑜,钟思荣,吴凌敏,谢丽娟,聂亚平,周玮,王建革,刘齐元. 作物学报. 2016(12)
[2]枣树雄性不育种质控制杂交的育性及杂种的SSR分子鉴定[J]. 孙学超,王玖瑞,代丽,赵锦,刘孟军. 河北农业大学学报. 2015(05)
[3]atp1基因在小麦BNS雄性不育系和自身转换系中的差异表达[J]. 赵大华,孙慧慧,于同英,李友勇. 生命科学研究. 2014(06)
[4]枣树免去雄杂交育种的设计与实践[J]. 刘孟军,王玖瑞,刘平,林敏娟,肖京,刘志国,孙学超. 园艺学报. 2014(07)
[5]红麻质核互作型雄性不育相关基因atp1的克隆与分析[J]. 陈艳翠,黄思齐,李建军,唐慧娟,陈安国,李德芳. 中国麻业科学. 2013(02)
[6]不结球白菜Pol胞质雄性不育系和保持系蕾期基因的差异表达[J]. 张昌伟,张蜀宁,侯喜林,齐莉,孙菲菲. 西北植物学报. 2010(08)
[7]3个南方枣品种花粉育性与花粉形态的观察[J]. 唐宁浩,何钢,李樊,赵思东,刘贤桂. 经济林研究. 2009(04)
[8]苎麻线粒体基因CoxⅡ和atpA与细胞质雄性不育相关性分析[J]. 段继强,李建永,杜光辉,梁雪妮,刘飞虎. 中国农业科学. 2009(02)
[9]10个线粒体基因在甘蓝型油菜NCa不育系统不同组织中的转录调控及其与育性的关系(英文)[J]. 危文亮,王汉中,刘贵华. 遗传学报. 2007(01)
[10]植物花粉发育的分子生物学研究进展[J]. 刘乐承,张弢,曹家树. 长江大学学报(自科版)农学卷. 2006(03)
博士论文
[1]红麻atp9、atp6、atpA基因克隆、功能分析与分子标签发掘[D]. 赵艳红.广西大学 2014
[2]白菜两种胞质雄性不育系及其保持系蕾期基因表达差异分析及相关基因克隆[D]. 蒋明.浙江大学 2007
硕士论文
[1]红麻质核互作型雄性不育相关基因atp1的克隆和表达分析[D]. 陈艳翠.中国农业科学院 2013
本文编号:3718688
本文链接:https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3718688.html
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