马铃薯（Solanumtuberosum L.）试管薯形成主效QTL区段SNP标记加密及候选基因筛选

发布时间：2023-01-12 16:37

　　马铃薯（Solanum tuberosum L.）地下块茎所含营养物质丰富,具有很高的食用价值,是仅次于水稻、小麦和玉米的世界第四大粮食作物。本课题在前期的研究基础上,利用RNA-seq技术得到的转录组SNP位点开发SNP标记并筛选差异表达基因,对短日照条件下马铃薯试管薯形成能力相关的主效QTL区段MT05进行SNP标记加密,进一步缩小其遗传置信区间。同时,对主效QTL区段内的候选基因进行表达验证与筛选,确定影响试管薯形成的关键候选基因。主要研究结果如下:1、基于BSA RNA-seq数据,本研究挑选了464个SNP位点用于群体基因分型,并依据SNP剂量信息模型和四倍体作图软件成功构建了第V号染色体MT05区段的双亲整合遗传连锁图谱,图谱全长42.07cM,包含193个SNP标记,平均标记间距0.22cM,包含了双亲的全部8条同源染色体。2、结合MTI群体的试管薯形成数据,本研究在新的整合图谱上进行QTL定位。结果显示2014年的表型数据定位到的QTL的LOD峰值位于14 cM处,其one-LOD置信区间为13-18 cM;2016年的表型数据定位到的QTL的LOD峰值位于32 cM处... 

【文章页数】：81 页

【学位级别】：硕士

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摘要
Abstract
缩略词表
第一章 前言
    1.1 马铃薯的种植及影响
    1.2 多因素调控马铃薯块茎形成发育
        1.2.1 温度对马铃薯块茎形成的影响
        1.2.2 蔗糖浓度对马铃薯试管薯形成的影响
        1.2.3 光周期对马铃薯块茎发育的调控
    1.3 马铃薯块茎发育的遗传调控
    1.4 试管薯的形成和优势
    1.5 课题提出
第二章 SNP标记加密及QTL定位
    2.1 材料与方法
        2.1.1 植物材料
        2.1.2 差异SNP位点挑选原则
        2.1.3 F1代分离群体SNP标记检测及基因型分析
        2.1.4 遗传连锁图镨构建及试管薯形成QTL定位分析
    2.2 结果与分析
        2.2.1 MTI群体遗传连锁图谱构建
        2.2.2 试管薯形成QTL定位
        2.2.3 标记与表型的关联分析
        2.2.4 QTL区间对应物理位置的进一步确认
第三章试管薯形成相关基因的筛选和鉴定
    3.1 材料与方法
        3.1.1 供试材料及处理方法
        3.1.2 Trizol法提取植物总RNA
        3.1.3 RNA样品质量检测及反转录
        3.1.4 样品不同时间点混样的定量检测
        3.1.5 荧光定量PCR
    3.2 结果与分析
        3.2.1 不同基因型材料不同基因型材料光周期诱导结薯的表型鉴定
        3.2.2 马铃薯试管薯短日照块茎形成候选基因定量表达检测
第四章 讨论
    4.1 主效区段SNP标记及QTL定位
    4.2 候选基因筛选
    4.3 研究展望
参考文献
附录
    附录A SNP标记位点及引物
    附表B 基因定量表达引物
致谢


【参考文献】：
期刊论文
[1]蔗糖调节马铃薯块茎形成机制的研究进展[J]. 巩慧玲,孙梦遥,冯再平,袁惠君.  中国蔬菜. 2016(03)
[2]马铃薯产业的现状与发展[J]. 谢从华.  华中农业大学学报(社会科学版). 2012(01)
[3]我国马铃薯生产发展综述[J]. 魏俊杰.  吉林农业. 2011(02)
[4]马铃薯试管薯诱导影响因子的研究[J]. 刘尚前,袁丁,张凤英,栗占芳.  安徽农业科学. 2007(21)
[5]马铃薯class Ⅰ patatin基因在试管块茎形成中的功能[J]. 司怀军,柳俊,谢从华.  作物学报. 2006(09)
[6]植物体中的糖信号及其转导机制[J]. 单守明,董晓颖,王永章,刘成连,原永兵.  中国农学通报. 2004(03)
[7]园艺植物高温逆境生理研究进展[J]. 范双喜,谷建田,韩莹琰.  北京农学院学报. 2003(02)
[8]植物超氧化物歧化酶（SOD）的研究进展[J]. 马旭俊,朱大海.  遗传. 2003(02)
[9]分子遗传标记类型及其在作物种质资源研究上的应用[J]. 王金英,江川.  福建稻麦科技. 2002(03)
[10]马铃薯块茎发育机理及其基因表达[J]. 柳俊,谢从华.  植物学通报. 2001(05)

博士论文
[1]马铃薯（Solanum tuberosum L.）试管块茎形成的QTL定位及遗传分析[D]. 周俊.华中农业大学 2014

硕士论文
[1]马铃薯（Solanum tuberosum L.）试管薯形成相关SNP标记的开发与QTL分析[D]. 杨艳佩.华中农业大学 2016



本文编号：3730147