生物信息学分析缺血性脑卒中的差异表达基因

发布时间：2023-02-25 16:02

　　目的基于生物信息学,对缺血性脑卒中(IS)相关差异表达基因(DEGs)进行分子层面的分析,深入分析IS的发病机制和关键基因。方法从GEO数据库下载与IS相关的生物基因芯片,基于P值及log|FC|值对GEO原始数据进行筛选,确定DEGs。对DEGs进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,了解DEGs介导的生物过程与代谢通路。利用String在线平台,构建DEGs的蛋白相互作用(PPI)网络。利用cytoscape的cyto Hubba软件,找出IS的关键基因。结果本研究共筛选出110个DEGs。功能和通路富集结果显示,上述基因参与MAPK、NF-kappa B、TNF等多种细胞因子和趋化因子的信号转导通路;共同介导炎症以及免疫应答、细胞凋亡等相关生物过程。PPI网络显示,这些基因之间具有相互作用关系。JUN、CXCL2和TNF为IS病理过程中的关键基因。结论本研究结果揭示,IS的发生发展与炎症密切相关。针对关键基因进行靶向治疗,如JUN、CXCL2和TNF,或许对临床防治IS具有重要的发展意义。

【文章页数】：5 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 芯片信息的获取
    1.2 DEGs的确定
    1.3 功能富集与通路分析
    1.4 PPI网络分析
2 结果与分析
    2.1 芯片和DEGs的信息
    2.2 GO功能富集分析
    2.3 KEGG通路富集分析
    2.4 PPI网络分析
3 讨论



本文编号：3748759