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吉林人参Dof基因家族的系统分析及PgDof14-1和PgDof26-5基因功能的初步研究

发布时间:2023-03-21 18:45
  人参(Panax ginseng C.A.Meyer)是五加科(Araliaceae)人参属(Panax)多年生草本药用植物,DNA binding with one finger(Dof)蛋白是植物中特有的一类转录因子。为初步探究人参中Dof基因的功能,本研究以实验室构建的吉林人参248,993 Unigenes数据库为基础,共挖掘75条吉林人参Dof Unigenes(Pg Dofs),其中有54条具备完整的开放阅读框和保守结构域。对这些基因进行生物信息学分析,挖掘出2条与皂苷含量相关的基因Pg Dof14-1和Pg Dof26-5,在吉林人参中克隆上述基因,并以根癌农杆菌和发根农杆菌介导法分别转化拟南芥和诱导人参发状根,以期为这两条基因的功能验证奠定基础,研究结果如下:1.75条Pg Dofs基因长度平均分布在200bp-2400bp之间。2.Dof蛋白普遍参与植物生物过程、分子功能与细胞成分三个方面,在level2水平上主要功能集中于8个功能类别:包括细胞过程(Cellular process,GO:0009987)、代谢过程(Metabolic process,GO:0008...

【文章页数】:85 页

【文章目录】:
摘要
Abstract
第一章 前言
    1.1 人参概述
    1.2 人参皂苷
    1.3 人参发状根
    1.4 Dof转录因子
    1.5 Dof蛋白参与植物的抗冷胁迫
    1.6 目的与意义
第二章 材料与方法
    2.1 实验材料
    2.2 仪器和软件
    2.3 实验方法
第三章 结果与分析
    3.1 PgDofs的生物信息学
    3.2 PgDof14-1、PgDof26-5 基因的生物信息学分析
    3.3 目的基因的克隆及表达载体的构建
    3.4 冷胁迫处理下候选基因的表达分析
    3.5 拟南芥的遗传转化
    3.6 人参幼苗的遗传转化及检测
第四章 讨论
    4.1 PgDofs的生物信息学分析
    4.2 PgDof14-1和PgDof26-5的生物信息学分析
    4.3 冷胁迫处理下候选基因的表达分析
    4.4 PgDof14-1、PgDof26-5 基因转化拟南芥的研究
    4.5 PgDof14-1、PgDof26-5 基因转化人参幼苗的研究
第五章 结论
参考文献
附录
    附表1 PgDofs与人参皂苷含量的显著性分析
    附表2 PgDofs与关键酶基因表达量的显著性分析
    附表3 PgDofs的 SNP与皂苷含量的显著性分析
作者简介
致谢



本文编号:3767096

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