干燥综合征基因差异谱的生物信息学分析

发布时间：2023-03-23 20:57

　　目的:应用生物信息学方法研究干燥综合征的差异基因,为干燥综合征的治疗提供新靶点。方法:在GEO数据库中下载并筛选干燥综合征相关的差异表达基因,利用STRING在线数据库构建蛋白与蛋白相互作用关系网络,运用Cytoscape软件筛选出关键基因,通过DAVID数据平台对差异基因进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。结果:通过分析基因芯片GSE127952后获得406个差异基因,筛选出STAT1、MX1、IFIT1、IFIT3、ISG15等10个关键基因;GO分析显示差异基因主要富集在正向调节细胞因子产生、淋巴细胞分化、T细胞活化等生物学过程;KEGG分析主要涉及细胞因子与细胞因子受体的相互作用、趋化因子信号通路、Toll样受体信号通路、T细胞受体信号通路等。结论:上述所得的关键基因和信号通路可能与干燥综合征的疾病过程相关,为深入研究靶向治疗干燥综合征提供了理论参考。

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 材 料
    1.2 筛选pSS差异表达基因
    1.3 PPI分析
    1.4 差异表达基因的富集分析
2 结 果
    2.1 差异基因的筛选
    2.2 构建PPI网络和筛选关键差异基因
    2.3 差异基因的GO和KEGG富集分析
3 讨 论



本文编号：3768741