多胺对盐胁迫下黄瓜SOS2基因家族表达的影响

发布时间：2023-03-30 20:02

　　该研究基于黄瓜基因组数据库,利用生物信息学和荧光定量PCR等方法,对黄瓜SOS2基因家族进行全基因组鉴定,并对其表达特性进行系统分析。结果表明:(1)在黄瓜基因组中,共鉴定到15个SOS2基因(CsSOS2-1～CsSOS2-15),且不均匀分布在5条染色体上;亚细胞定位显示SOS2蛋白主要位于细胞质膜。(2)系统进化分析显示,CsSOS2-2和CsSOS2-6与AtSOS2亲缘关系更近。(3)顺式作用元件预测显示,SOS2基因启动子序列主要含有干旱诱导和防御应激响应元件。(4)结构分析显示,SOS2蛋白所含保守基序的排列顺序完全一致,且主要含有STKc和NAF保守结构域,这些结构可能在基因响应盐胁迫过程中起调控作用。(5)荧光定量试验表明,SOS2基因家族主要在黄瓜的根和叶片响应盐胁迫时上调表达,其中,盐胁迫处理1 d时有5个基因上调表达,并随处理时间延长盐胁迫下的基因表达有所下调;增施多胺显著上调了CsSOS2-1～CsSOS2-5、CsSOS2-8、CsSOS2-9、CsSOS2-12和CsSOS2-15在不同组织中的表达,说明盐胁迫下多胺能诱导黄瓜SOS2基因家族的表达,进而参...

【文章页数】：11 页

【文章目录】：
1 材料和方法
    1.1 试验材料
    1.2 SOS2基因家族鉴定
        1.2.1 黄瓜SOS2基因家族成员筛选
        1.2.2 黄瓜SOS2基因家族蛋白理化性质分析
        1.2.3 黄瓜SOS2基因家族成员的染色体定位
        1.2.4 黄瓜SOS2基因家族系统发育树构建
        1.2.5 黄瓜SOS2基因的顺式作用元件预测
        1.2.6 黄瓜SOS2蛋白保守结构域及保守基序分析
    1.3 qRT-PCR定量分析
    1.4 数据处理
2 结果与分析
    2.1 黄瓜SOS2基因家族成员鉴定及理化性质分析
    2.2 黄瓜SOS2基因家族成员染色体定位
    2.3 黄瓜SOS2蛋白的遗传进化分析
    2.4 黄瓜SOS2基因家族的顺式作用元件预测
    2.5 黄瓜SOS2蛋白的结构分析
    2.6 黄瓜SOS2基因家族表达分析
3 讨 论



本文编号：3775397