遗传性肥胖儿童失调的肠道菌群对无菌小鼠结肠和肝脏miRNA和基因表达的影响

发布时间：2023-04-02 22:24

　　越来越多的证据表明,失调的肠道菌群是引发肥胖及其相关慢性代谢性疾病的一个重要病理原因。我们之前对Prader-Willi syndrome(PWS)遗传性肥胖儿童膳食干预临床试验的结果指出,患者健康指数的改善与他们肠道菌群明显的转变相关。将其中一名PWS儿童膳食干预前和膳食干预后的肠道菌群分别移植给两组无菌小鼠,分别被称为pre组和post组。与post组相比,移植了同一PWS儿童膳食干预前失调的肠道菌群的pre组有着更强的炎症反应和更多的脂肪积累。本研究利用RNA-seq技术对这两组小鼠在菌群移植后两周和四周时结肠和肝脏miRNA和基因的表达情况进行观察,以post组作为对照,干预前失调的肠道菌群引起了pre组小鼠miRNA和基因不同的表达,且差异表达的miRNA和基因集中在菌群移植后两周时。对筛选出来的差异表达的miRNA的有效的靶基因进行富集分析,大部分被显著富集的GO生物学过程和KEGG通路是在肝脏两周时找到的。我们筛选出了与小鼠表型差异相关的23个关键基因和调控它们的73个miRNA,并构建了在失调的肠道菌群的压力下miRNA-基因-生物学功能的调控网络。该网络中包含了92对...

【文章页数】：85 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
第一章 文献综述
    1.1 肠道菌群与肥胖及其相关代谢性疾病的关系
        1.1.1 肥胖的流行和危害
        1.1.2 肠道菌群概述
        1.1.3 失调的肠道菌群是肥胖及其相关代谢性疾病的重要诱因
    1.2 miRNA 概述
        1.2.1 miRNA简介
        1.2.2 miRNA表达水平的检测方法
        1.2.3 miRNA靶基因的预测方法
    1.3 肠道菌群与宿主miRNA之间关系的研究进展
    1.4 本研究的背景和目的
第二章 来自同一遗传性肥胖儿童不同健康状态的肠道菌群能够引起无菌小鼠结肠和肝脏miRNA和基因不同的表达
    引言
    2.1 材料和方法
        2.1.1 动物实验
        2.1.2 miRNA测序
        2.1.3 转录组测序
        2.1.4 miRNA表达谱的获取
        2.1.5 基因表达谱的获取
        2.1.6 差异表达分析
    2.2 实验结果
        2.2.1 miRNA测序数据质控、预处理和比对结果
        2.2.2 转录组测序数据质控、预处理和比对结果
        2.2.3 两组小鼠之间差异表达的miRNA和基因
    2.3 讨论
第三章 来自遗传性肥胖儿童失调的肠道菌群在引发小鼠炎症和脂质积累过程中结肠和肝脏的miRNA-基因调控网络
    引言
    3.1 材料和方法
        3.1.1 材料
        3.1.2 靶基因预测
        3.1.3 GO和 KEGG富集分析
        3.1.4 关键基因的提取和功能注释
        3.1.5 miRNA、基因和生物学功能调控网络的构建
        3.1.6 miRNA和基因与生化指标的相关分析
    3.2 实验结果
        3.2.1 受差异表达的miRNA调控的有效的靶基因
        3.2.2 有效的靶基因显著富集的GO生物学过程和KEGG通路
        3.2.3 与宿主脂质和胆固醇代谢、葡萄糖稳态和炎症有关的miRNA-靶基因-生物学功能调控网络
        3.2.4 miRNA和基因的表达与小鼠表型的相关性
    3.3 讨论
总结
参考文献
附表1 各样本miRNA测序、预处理和比对的详细情况
附表2 各样本转录组测序、预处理和比对的详细情况
附表3 差异表达的miRNA的有效的靶基因
附表4 网络图中92对miRNA和基因相关分析的详细结果
附录1 英文缩写和全称
致谢
研究生期间已发表或待发表的论文
学术会议论文



本文编号：3780081