大鼠肝再生中基因转录变化的调节机理研究
发布时间：2023-05-18 21:51
肝脏具有许多重要的功能,如合成、解毒和代谢等。肝脏具有独特的再生能力,在物理、化学、生物等因素的诱导下,残肝细胞迅速活化,进入细胞周期和细胞增殖的过程以补偿丢失的肝组织并恢复肝脏的生物学功能,此过程称为肝再生(liver regeneration,LR)。肝脏再生是一个由多种因素共同调节控制的复杂精密过程,由多细胞和多因子参与,涉及多种生理生化活动。本文从调节组学出发,探究大鼠肝再生中基因甲基化、miRNA、lncRNA、circRNA、蛋白磷酸化、蛋白乙酰化、蛋白糖基化、蛋白泛素化等调控方式对基因转录活动的调节作用以及它们对肝再生进程的影响,进一步阐明大鼠肝再生的分子机理。本研究以SD大鼠的2/3肝切除作为模型,通过高通量测序得到大鼠肝再生中基因甲基化、miRNA、lncRNA、circRNA、蛋白磷酸化、蛋白乙酰化、蛋白糖基化、蛋白泛素化等调控方式涉及的基因/RNA/蛋白的种类及表达变化,用GO、NCBI和IPA等网站和软件确定与基因转录活动相关的基因/RNA/蛋白,生物统计和计算机分析等得到其ratio值进而筛选出差异基因/RNA/蛋白,系统生物学等方法分析它们在大鼠肝再生基因转...
【文章页数】：82 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
1 文献综述
1.1 大鼠肝再生
1.1.1 大鼠2/3 肝再生模型制备
1.1.2 大鼠肝再生进程
1.1.3 大鼠肝再生的机理
1.2 大鼠肝再生的分子调节
1.2.1 基因甲基化对大鼠肝再生的调节作用
1.2.2 miRNA对大鼠肝再生的调节作用
1.2.3 lncRNA对大鼠肝再生的调节作用
1.2.4 circRNA对大鼠肝再生的调节作用
1.2.5 蛋白磷酸化修饰对大鼠肝再生的调节作用
1.2.6 蛋白乙酰化修饰对大鼠肝再生的调节作用
1.2.7 蛋白糖基化修饰对大鼠肝再生的调节作用
1.2.8 蛋白泛素化修饰对大鼠肝再生的调节作用
1.2.9 大鼠肝再生中各调节方式的关联性
1.3 研究目的和意义
1.3.1 研究目的
1.3.2 研究意义
2 材料与方法
2.1 实验用大鼠
2.2 大鼠2/3 肝切除模型制备
2.3 大鼠再生肝的获得
2.4 生理活动相关基因的确认
2.5 基因甲基化的生物高通量检测与分析
2.6 miRNA的生物高通量检测与分析
2.7 lncRNA的生物高通量检测与分析
2.8 circRNA的生物高通量检测与分析
2.9 蛋白修饰的生物高通量检测与分析
3.结果
3.1 大鼠肝再生中基因转录相关mRNA表达变化
3.2 大鼠肝再生中基因转录相关蛋白表达变化
3.3 大鼠肝再生中基因转录相关基因的甲基化变化
3.4 大鼠肝再生中基因转录相关miRNA表达变化
3.5 大鼠肝再生中基因转录相关lncRNA表达变化
3.6 大鼠肝再生中基因转录相关circRNA表达变化
3.7 大鼠肝再生中基因转录相关蛋白的磷酸化变化
3.8 大鼠肝再生中基因转录相关蛋白的乙酰化变化
3.9 大鼠肝再生中基因转录相关蛋白的糖基化变化
3.10 大鼠肝再生中基因转录相关蛋白的泛素化变化
3.11 大鼠肝再生中基因转录相关mRNA/蛋白的表达相关性
3.12 大鼠肝再生中基因转录相关基因甲基化/mRNA的丰度相关性
3.13 大鼠肝再生中基因转录相关miRNA/mRNA的表达相关性
3.14 大鼠肝再生中基因转录相关lncRNA/mRNA的表达相关性
3.15 大鼠肝再生中基因转录相关circRNA/miRNA/mRNA的表达相关性
3.16 大鼠肝再生中基因转录相关蛋白磷酸化/蛋白的丰度相关性
3.17 大鼠肝再生中基因转录相关蛋白乙酰化/蛋白的丰度相关性
3.18 大鼠肝再生中基因转录相关蛋白糖基化/蛋白的丰度相关性
3.19 大鼠肝再生中基因转录相关蛋白泛素化/蛋白的丰度相关性
3.20 大鼠肝再生中基因转录相关基因甲基化/mRNA/蛋白的丰度相关性
3.21 大鼠肝再生中基因转录相关miRNA/mRNA/蛋白的表达相关性
3.22 大鼠肝再生中基因转录相关lncRNA/mRNA/蛋白的表达相关性
3.23 大鼠肝再生中基因转录相关circRNA/miRNA/mRNA/蛋白的表达相关性
3.24 大鼠肝再生中基因转录相关mRNA/蛋白/蛋白磷酸化的丰度相关性
3.25 大鼠肝再生中基因转录相关mRNA/蛋白/蛋白乙酰化的丰度相关性
3.26 大鼠肝再生中基因转录相关mRNA/蛋白/蛋白糖基化的丰度相关性
3.27 大鼠肝再生中基因转录相关mRNA/蛋白/蛋白泛素化的丰度相关性
4.论讨
4.1 基因甲基化对大鼠再生肝基因转录活动的调节作用分析
4.2 miRNA对大鼠再生肝基因转录活动的调节作用分析
4.3 lncRNA对大鼠再生肝基因转录活动的调节作用分析
4.4 circRNA对大鼠再生肝基因转录活动的调节作用分析
4.5 蛋白磷酸化修饰对大鼠再生肝基因转录活动的调节作用分析
4.6 蛋白乙酰化修饰对大鼠再生肝基因转录活动的调节作用分析
4.7 蛋白糖基化修饰对大鼠再生肝基因转录活动的调节作用分析
4.8 蛋白泛素化修饰对大鼠再生肝基因转录活动的调节作用分析
参考文献
结论
致谢
攻读硕士学位期间发表的学术论文目录
本文编号：3819063
【文章页数】：82 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
1 文献综述
1.1 大鼠肝再生
1.1.1 大鼠2/3 肝再生模型制备
1.1.2 大鼠肝再生进程
1.1.3 大鼠肝再生的机理
1.2 大鼠肝再生的分子调节
1.2.1 基因甲基化对大鼠肝再生的调节作用
1.2.2 miRNA对大鼠肝再生的调节作用
1.2.3 lncRNA对大鼠肝再生的调节作用
1.2.4 circRNA对大鼠肝再生的调节作用
1.2.5 蛋白磷酸化修饰对大鼠肝再生的调节作用
1.2.6 蛋白乙酰化修饰对大鼠肝再生的调节作用
1.2.7 蛋白糖基化修饰对大鼠肝再生的调节作用
1.2.8 蛋白泛素化修饰对大鼠肝再生的调节作用
1.2.9 大鼠肝再生中各调节方式的关联性
1.3 研究目的和意义
1.3.1 研究目的
1.3.2 研究意义
2 材料与方法
2.1 实验用大鼠
2.2 大鼠2/3 肝切除模型制备
2.3 大鼠再生肝的获得
2.4 生理活动相关基因的确认
2.5 基因甲基化的生物高通量检测与分析
2.6 miRNA的生物高通量检测与分析
2.7 lncRNA的生物高通量检测与分析
2.8 circRNA的生物高通量检测与分析
2.9 蛋白修饰的生物高通量检测与分析
3.结果
3.1 大鼠肝再生中基因转录相关mRNA表达变化
3.2 大鼠肝再生中基因转录相关蛋白表达变化
3.3 大鼠肝再生中基因转录相关基因的甲基化变化
3.4 大鼠肝再生中基因转录相关miRNA表达变化
3.5 大鼠肝再生中基因转录相关lncRNA表达变化
3.6 大鼠肝再生中基因转录相关circRNA表达变化
3.7 大鼠肝再生中基因转录相关蛋白的磷酸化变化
3.8 大鼠肝再生中基因转录相关蛋白的乙酰化变化
3.9 大鼠肝再生中基因转录相关蛋白的糖基化变化
3.10 大鼠肝再生中基因转录相关蛋白的泛素化变化
3.11 大鼠肝再生中基因转录相关mRNA/蛋白的表达相关性
3.12 大鼠肝再生中基因转录相关基因甲基化/mRNA的丰度相关性
3.13 大鼠肝再生中基因转录相关miRNA/mRNA的表达相关性
3.14 大鼠肝再生中基因转录相关lncRNA/mRNA的表达相关性
3.15 大鼠肝再生中基因转录相关circRNA/miRNA/mRNA的表达相关性
3.16 大鼠肝再生中基因转录相关蛋白磷酸化/蛋白的丰度相关性
3.17 大鼠肝再生中基因转录相关蛋白乙酰化/蛋白的丰度相关性
3.18 大鼠肝再生中基因转录相关蛋白糖基化/蛋白的丰度相关性
3.19 大鼠肝再生中基因转录相关蛋白泛素化/蛋白的丰度相关性
3.20 大鼠肝再生中基因转录相关基因甲基化/mRNA/蛋白的丰度相关性
3.21 大鼠肝再生中基因转录相关miRNA/mRNA/蛋白的表达相关性
3.22 大鼠肝再生中基因转录相关lncRNA/mRNA/蛋白的表达相关性
3.23 大鼠肝再生中基因转录相关circRNA/miRNA/mRNA/蛋白的表达相关性
3.24 大鼠肝再生中基因转录相关mRNA/蛋白/蛋白磷酸化的丰度相关性
3.25 大鼠肝再生中基因转录相关mRNA/蛋白/蛋白乙酰化的丰度相关性
3.26 大鼠肝再生中基因转录相关mRNA/蛋白/蛋白糖基化的丰度相关性
3.27 大鼠肝再生中基因转录相关mRNA/蛋白/蛋白泛素化的丰度相关性
4.论讨
4.1 基因甲基化对大鼠再生肝基因转录活动的调节作用分析
4.2 miRNA对大鼠再生肝基因转录活动的调节作用分析
4.3 lncRNA对大鼠再生肝基因转录活动的调节作用分析
4.4 circRNA对大鼠再生肝基因转录活动的调节作用分析
4.5 蛋白磷酸化修饰对大鼠再生肝基因转录活动的调节作用分析
4.6 蛋白乙酰化修饰对大鼠再生肝基因转录活动的调节作用分析
4.7 蛋白糖基化修饰对大鼠再生肝基因转录活动的调节作用分析
4.8 蛋白泛素化修饰对大鼠再生肝基因转录活动的调节作用分析
参考文献
结论
致谢
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本文编号：3819063
本文链接：https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3819063.html
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