2018年湖南省登革病毒2型分离株非结构蛋白1基因的鉴定及分析

发布时间：2023-10-15 16:43

　　目的鉴定并分析2018年湖南省登革病毒2型(dengue virus 2,DENV-2)分离株的非结构蛋白1(non-structural protein 1,NS1)基因。方法利用试剂盒提取登革热患者血清RNA,RT-PCR法鉴定病毒类型及扩增11株分离株NS1基因,并进行基因测序。应用MEGA 7.0软件分析分离株与DENV-2标准株(KM204118)的NS1基因核苷酸及氨基酸序列,利用最大似然法(1000 Boot strap replicate)构建NS1基因的系统进化树。结果共获得11株分离株的NS1基因,经比对发现,除分离株HNNS201804和HNNS201810外,其余分离株在NS1基因第585位碱基由T变为C(无义突变);HNNS201806的NS1基因第936位碱基由C变为T(无义突变)。11株分离株NS1基因其他突变位点均相同,共68处发生碱基突变,其中9个为有义突变。11株分离株与China-ZJ(2017-MH110594)、China-GZ(2018-MK564485、2015-KX621245、2017-MK564483)、Thailand(2017-L...

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 样品
    1.2 主要试剂
    1.3 DEN V型别鉴定
    1.4 DENV-2 NS1片段的特异性扩增
    1.5 NS1核苷酸及氨基酸的序列对比
    1.6 NS1基因进化树的构建
2 结果
    2.1 DEN V的型别鉴定
    2.2 DEN V-2 NS1基因特异性扩增产物鉴定
    2.3 NS1的核苷酸及氨基酸BLAST比对
    2.4 NS1基因进化树分析
3 讨论



本文编号：3854275