青峪猪生长发育规律和拐点期差异表达基因及最佳肉质性状日龄研究

发布时间：2023-12-02 09:31

　　青峪猪主要分布在四川盆地北部大巴山区,是湖川山地猪在四川盆周山区的一个类群。青峪猪具有耐粗饲、适应性强,肉质好等特点,尤其以富含“雪花肉”而著称。和很多地方猪品种一样,青峪猪一直缺乏有效保护,生物学特性相关的基础研究十分有限。为更好的保护这一独特的品种资源,针对青峪猪的生长发育规律和不同生长阶段的基因表达特性及肉质性状差异开展了研究。首先,利用Gompertz、Logistic和Von Bertalanffy等3种非线性模型对青峪猪的体重和体尺生长规律进行非线性拟合,得到了相应的生长曲线。并通过残差标准误(RSE)、决定系数(R²)、校正系数R²(adj.R²)、赤池信息准则(AIC)和贝叶斯信息准则(BIC)等评估各模型的最优拟合度,确定体重和体尺的最佳数学模型,并计算相应的最大生长速度拐点(MGR)、“慢增期—快增期”拐点(GRI)和“快增期—缓增期”拐点(RSI)等重要生理参数。再建立混合效应模型进一步探究体重和体尺的基本生长发育规律。选取3个拐点(MGR,GRI和RSI)肌肉样品进行转录组测序(RNA-seq),...

【文章页数】：78 页

【学位级别】：硕士

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摘要
Abstract
缩略词
1 文献综述
    1.1 青峪猪概述
        1.1.1 品种简介
        1.1.2 生产性能
    1.2 生长曲线拟合
        1.2.1 动物生长发育规律
        1.2.2 生长曲线模型
        1.2.3 生长曲线应用
    1.3 生长拐点和生长相关基因
        1.3.1 生长曲线拐点研究
        1.3.2 生长相关基因
    1.4 猪肉质性状
        1.4.1 影响因素
        1.4.2 测定指标
    1.5 生长发育与肉质性能
    1.6 研究目的及意义
2 材料与方法
    2.1 主要仪器和试剂
    2.2 生长曲线拟合
        2.2.1 实验材料
        2.2.2 生长曲线拟合
    2.3 转录组测序和分析
        2.3.1 样品采集
        2.3.2 RNA提取
        2.3.3 测序和分析
    2.4 屠宰测定和主成分分析
        2.4.1 屠宰群体
        2.4.2 测定指标
        2.4.3 主成分分析
    2.5 数据统计分析
3 结果与分析
    3.1 生长曲线拟合
    3.2 青峪猪生长发育规律
        3.2.1 体尺生长发育规律
        3.2.2 体重和体尺生长发育的相关性
        3.2.3 体重生长发育的影响因素
    3.3 生长拐点期基因表达差异的研究
        3.3.1 三个拐点转录组差异比较
        3.3.2 不同阶段差异基因GO和 Pathway富集分析
    3.4 不同屠宰日龄胴体和肉质性状研究
        3.4.1 不同屠宰日龄胴体性状研究
        3.4.2 不同屠宰日龄肉质性状研究
        3.4.3 不同屠宰日龄肉质性能主成分分析
4 讨论
    4.1 青峪猪最优生长曲线
    4.2 青峪猪体重和体尺生长发育
    4.3 青峪猪体重的影响因素
    4.4 生长拐点基因差异表达研究
    4.5 不同日龄的胴体和肉质的研究
5 结论
参考文献
致谢
附录
作者简历



本文编号：3869391