脊椎动物神经型nAChRs基因家族功能分化图谱分析

发布时间：2023-12-04 18:35

　　研究目的:烟碱型乙酰胆碱受体(nAChRs)属于五聚体配体门控离子通道或半胱氨酸环受体,传导快速突触信号在中枢和外周神经系统。它们可以被内源性神经递质乙酰胆碱和外源性配体如尼古丁激活。它们还与多种神经系统疾病如肌无力、精神分裂症、帕金森病、阿尔茨海默病和尼古丁成瘾等有密切关系。现在对nAChRs亚基及受体在神经系统作用的分子机制及其与各种疾病的关系还不完全理解。随着基因组学的快速发展和相关数据的积累,通过对nAChRs基因家族进行进化分析探究其功能分化成为可能。在本研究中,通过系统发育和最大似然分析方法,研究脊椎动物神经型nAChRs基因家族的进化,并分析其进化特征,和与亚基功能分化相关的位点,确定受体功能特异性的位点。研究方法:1.本研究选取了十二种包括人在内的脊椎动物,收集其神经型nAChRs基因家族同源蛋白质编码区的核酸序列。2.对所有基因的核苷酸序列进行处理。去掉每条序列中信号肽片段对应的核苷酸。对处理好的数据进行多序列比对和构建系统发育进化树;3.通过系统发育分析和最大似然法,根据系统发育树,计算每个亚基和每个部落的选择压力,即dN/dS;4.分析每个亚基在脊椎动物和位点间的...

【文章页数】：82 页

【学位级别】：硕士

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中文摘要
Abstract
缩略语/符号说明
一、前言
    1.1 研究现状、成果
    1.2 研究目的、方法
二、原理与方法
    2.1 数据收集
    2.2 多序列比对
    2.3 系统发育分析
    2.4 测量自然选择
        2.4.1 计算dN/dS的三个步骤
        2.4.2 马尔可夫过程
        2.4.3 估计dN/dS
    2.5 结构模型
    附图
三、结果
    3.1 脊椎动物中的神经型nAChRs亚基
    3.2 脊椎动物神经型nAChR亚基的的多序列比对
    3.3 脊椎动物中的神经型nAChRs亚基的系统发育分析
    3.4 脊椎动物神经型nAChRs亚基在不同的选择压力的模式下
    3.5 脊椎动物神经型nAChRs基因家族部落的功能分化检测
    3.6 神经型nAChRs亚基在脊椎动物中的进化
四、讨论与结论
    4.1 讨论
        4.1.1 脊椎动物神经型nAChRs亚基的保守特征
        4.1.2 脊椎动物神经型nAChRs亚基的分子进化
        4.1.3 脊椎动物神经型nAChRs亚基的每个部落的功能特异性
        4.1.4 脊椎动物神经型nAChRs亚基的进化特征
    4.2 结论
参考文献
发表论文和参加科研情况说明
附录
    附录1 椎动物中的烟碱型乙酰胆碱受体基因序列集
    附录2 九个脊椎动物神经型nAChRs亚基的ICD的多序列比对
综述 变构受体:从电器官到认知
    综述参考文献
致谢
个人简历



本文编号：3870487