大豆Glyma.05G222700.2基因生物信息学与逆境表达分析

发布时间：2023-12-24 19:43

　　为研究Glyma.05G222700.2基因编码的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶在抗非生物胁迫过程的功能和原理,促进大豆抗逆候选基因的开发利用,本研究通过生物信息学方法对大豆Glyma.05G222700.2基因进行同源序列、蛋白结构、进化树和转录组分析,通过qRT-PCR分析盐胁迫下大豆不同组织中该基因的表达情况。结果表明:该基因编码区长2 040 bp,编码697个氨基酸,预测分子量为656.54 kD,pI8.026。多序列比对发现Glyma.05G222700.2蛋白包含1个Pkinase结构域。进化树分析表明该蛋白与野大豆、刺毛黧豆、赤豆一致性较高。转录组数据表明Glyma.05G222700.2基因在大豆各组织中均有表达,其中在种子中表达量最高,在根中表达量最低。qRT-PCR结果发现Glyma.05G222700.2基因在毛状根、茎、叶中均有表达,在茎中表达量最高,在叶中表达量最低;在毛状根中盐胁迫12 h表达量达到极值,盐胁迫24 h表达量下降;在茎中表达量呈上升趋势,在24 h表达量达到极值;在叶中表达量不稳定,盐胁迫2 h该基因不表达,盐胁迫6 h该基因表达量达到极值并高于...

【文章页数】：6 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 材料
    1.2 试验设计
    1.3 方法
        1.3.1 生物信息学分析
        1.3.2 总RNA提取
        1.3.3 cDNA合成
        1.3.4 qRT-PCR
    1.4 数据分析
2 结果与分析
    2.1 Glyma.05G222700.2基因序列分析
    2.2 Glyma.05G222700.2蛋白结构预测
    2.3 Glyma.05G222700.2基因组织特异性表达预测与检测
    2.4 Glyma.05G222700.2基因在盐胁迫下的表达量分析
3 讨 论
4 结 论



本文编号：3875186