肝癌微环境相关的预后关键基因鉴定及预后模型的构建

发布时间：2024-01-26 23:17

　　研究背景与目的尽管肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)的临床治疗手段近年来取得了重大的进展,但其仍然是常见的消化道恶性肿瘤。迫切需要寻找新的预后生物标志物和分子靶标。因此,本研究旨在鉴定肿瘤微环境相关的潜在预后关键基因,并通过联合临床特征构建肝癌预后模型。研究方法基于癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)中HCC患者的基因表达谱,使用ESTIMATE算法计算每个患者肿瘤样本中免疫细胞和基质细胞的浸润水平(即免疫评分和基质评分)。然后筛选高免疫/基质评分组和低免疫/基质评分组之间的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并利用生物信息学分析这些DEGs涉及的细胞生物学过程和信号传导通路。随后使用单因素cox分析筛选其中和预后相关的DEGs,并通过四个其他的HCC队列验证这些预后基因,再使用套索回归进一步筛选其中的预后关键基因。最后利用这些关键基因构建预后风险评分和预后模型。预后模型通过C指数和校准曲线来评估区分度和一致性。结果免疫/基质评分高的HCC患者比低评分的HCC患者具有...

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【学位级别】：硕士

图1高免疫评分和基质评分与肝癌患者的更好预后显着相关（A）根据免疫评分将患者分成两组比较无复发生存期；（B）根据免疫评分将患者分成两组比较无复发生存期；（C）根据基质评分将患者分成两组比较无复发生存期；（D）根据基质评分将患者分成两组比较总体生存期；（E-J）高免疫评分组

图2肝癌中与预后相关的差异表达基因的功能富集分析

图4147个预后相关差异基因在4个HCC队列中的验证

图6TCGA肝癌队列中10个关键基因与OS的相关性Kaplan-Meier生存曲线是通过使用KaplanMeierplotter网站（http://kmplot.com/analysis）绘制而成

本文编号：3885872