新疆汉族食管鱗癌mRNA差异表达基因的筛选

发布时间：2024-01-27 10:22

　　目的:本研究将利用基因芯片技术对新疆6对汉族食管鳞癌的癌组织及其癌旁正常组织进行分析,检测新疆汉族食管鳞癌的差异表达基因,并对其进行生物学分析。方法:1.取新疆石河子大学医学院第一附属医院兵团内镜中心2014年11月至2015年9月经内镜及病理诊断确诊的汉族食管鳞癌确诊患者癌组织及癌旁正常组织各6例。对所取组织进行总RNA的提取和纯化,并经过反复扩增并RT-PCR得到c DNA,用Cy3进行荧光标记,然后在含有34235个m RNAs检测探针的基因芯片上进行杂交。2.扫描基因芯片荧光信号图像,并使用软件对荧光信号图片结果进行分析,检测新疆汉族食管鳞癌的差异表达基因。结果:此次研究共筛选出汉族食管鳞癌差异表达的m RNAs337个,其中有140个表达上调的m RNAs和197个表达下调的m RNAs。对这些基因进行pathway、GO和disease富集分析。pathway富集分析显示这些差异表达的m RNAs共参与六个信号通路数据库49个信号通路,包括硬脂酸的生物合成、Sema4D介导的细胞粘附和迁移的抑制作用等。GO富集分析显示这些差异表达基因在细胞成分、生物学过程和分子功能方面共有...

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【学位级别】：硕士

图1食管鳞癌组织总RNA的1.2%甲醛变性胶电泳图

图2基因芯片杂交信号的扫描结果

图3汉族食管鳞癌差异表达的mRNAs聚类分析

图4汉族食管鳞癌差异表达mRNAs的火山图

本文编号：3886786