高原鼢鼠p53通路抑制血管生成基因生信分析及低氧应答

发布时间：2024-02-22 18:58

　　高原鼢鼠(Myospalax Baileyi)是青藏高原特有的地下鼠,对低氧环境有很强的适应能力。上调血管内皮生长因子(vasculai endothelial growth factor,VEGF),提高组织中微血管密度(microvessel density,MVD)是地下鼠适应低氧洞道生境的重要机制。但是,随着低氧程度增加,地下鼠组织中血管内皮生长因子表达受抑制,与SD大鼠的表达模式不同。这可能与p53结合HIF-1α后,通过增强下游抑制血管生成相关靶基因的转录,抑制微血管在低氧环境下无限制增长有关。本文以SD大鼠为对照,对高原鼢鼠p53及其下游抑制血管生成相关靶基因的编码区序列进行了生物信息学分析,研究在不同海拔条件下高原鼢鼠p53及其下游抑制血管生成相关靶基因的表达模式。高原鼢鼠与同为啮齿动物的以色列鼹鼠(Nannospalax galili)有较高的同源性。我们对多个物种的p53序列分析发现,高原鼢鼠p53基因309号位点甘氨酸(Gly,G)突变为天冬氨酸(Asp,D)。高原鼢鼠与以色列鼹鼠有2个(89 Ser和95 Pro)平行进化位点,我们认为这2个平行进化位点可能增强...

【文章页数】：123 页

【学位级别】：博士

【部分图文】：

图2.低氧对HIF-1α的调节

图2.低氧对HIF-1α的调节。主要途径用粗体箭头表示。ig2.RegulationofHIF-1αbyhypoxicresponse.ThemainpathwayofHIF-1αregulationypoxiaisdenotedwith....

图3.p53抑制血管生成通路图

士学位论文第1酸（K）与相邻单体上残基的结合，形成不稳定二聚体来适应从而影响一系列下游靶基因功能[212]。鼹鼠p53的这种变异削的能力，表现为Apaf1基因不表达，Puma、Pten以及Noxa达；增强了抑制细胞周期的功能，使得细胞周期抑制相关的基表达[2....

图4.p53相关靶基因通路图

因子（VEGF），还可介导与肝素硫酸蛋白多糖及一些整合素（如：α3β1、α4β1、α6β1和α9β1）结合，调节细胞间相互作用、细胞分化增殖及血小板聚集[230-232]；②原胶原同源区（procollagenhomologydomain,PC）：可通过亚基聚集抑制血管....

图5.22种哺乳动物的mtDNA系统进化树

5.22种哺乳动物的mtDNA系统进化树[383].分支长度与后验概率值（%）标注在高原鼢鼠以红星为代表。ure5.PhylogeneticTreeof22Mammals[383].Branchlengthwasshowedandposbabil....

本文编号：3907110