玉米大斑病菌Septin基因家族的鉴定与表达模式分析

发布时间：2024-03-02 15:19

　　【背景】隔膜蛋白Septin广泛存在于除植物以外所有真核生物中,是高度保守的GTP结合蛋白家族,被认为是继微管、微丝和中间纤维之后的第4种细胞骨架蛋白。病原真菌的Septin蛋白参与细胞极性的确定、形态塑造及与致病相关的形态转换。【目的】鉴定玉米大斑病菌(Setosphaeria turcica)Septin基因家族,并进一步分析其在不同发育时期的表达模式,为明确隔膜蛋白Septin与真菌侵染结构发育之间的关系打下基础。【方法】以玉米小斑病菌(Bipolaris maydis)中6个Septin蛋白的氨基酸序列为探针,在玉米大斑病菌数据库在线Blastp比对和关键词搜索,获得大斑病菌的候选Septin,对其基因结构、理化性质以及跨膜区结构等方面进行生物信息学分析。收集人造疏水介质诱导下侵染结构发育不同时期以及侵染感病寄主叶片不同时间的玉米大斑病菌材料,利用实时荧光定量PCR(real-time fluorescence quantitative PCR,RT-qPCR)技术系统分析Septin基因家族在玉米大斑病菌侵染结构形成不同阶段的转录水平。【结果】获得了玉米大斑病菌6个候选Sep...

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【部分图文】：

图1玉米大斑病菌Septin基因结构

不同植物病原真菌Septin同源基因在氨基酸水平上呈现高度的相似性，系统发育树分成两个大的进化支，玉米大斑病菌的StSep1、StSep2、StSep3、StSep4与不同病原真菌的核心Septin(Cdc3、Cdc10、Cdc11和Cdc12）聚于同一进化支，而StS....

图4玉米大斑病菌Septin的二级结构特征

分析Septin基因家族在病菌侵染感病寄主叶片过程中的转录水平，以接种初期1h的基因表达水平为对照。结果表明，StSep1和StSep4的转录水平均呈现先上调后下调的变化趋势。StSep1在接种后6h转录水平极显著上调（P<0.01），随后迅速下降，至接种后18h和2....

图5Septin表达模式分析

图4玉米大斑病菌Septin的二级结构特征3讨论

图3Septin的保守结构域分析

总体而言，相对分子质量最大的是StSep4，相对分子质量最小的是StSep1。StSep1的PI为7.20，属于中性蛋白质；StSep2、StSep4的PI分别为5.07、6.56，属于酸性蛋白质；StSep3的PI为8.54，属于碱性蛋白质（表4）。4个Septin....

本文编号：3917010