大豆种子成熟蛋白PM40基因表达方式分析及其启动子预测
发布时间:2024-03-09 01:56
研究大豆种子成熟蛋白PM40基因在不同逆境条件下及大豆各组织中的表达情况,并对其上游启动子序列进行生物信息学预测,为揭示PM40基因表达本质及其启动子的功能研究、利用提供理论依据。利用qRT-PCR方法,检测PM40基因在干旱、盐、低温、脱落酸条件下的表达;比较该基因在大豆根、茎、叶、花、30DAF、60DAF和90DAF中的表达;克隆PM40基因5′端上游启动子序列,并预测其含有的顺式作用元件。结果表明,PM40基因在干旱、低温和脱落酸处理不同时间下,与未处理相比,表达量均下降,在盐处理条件下,只有处理2 h时表达升高,其余处理时间基因表达下降,说明PM40基因受干旱、低温和脱落酸诱导表达下降,在盐诱导2 h时表达升高;PM40基因在大豆种子中的表达相对较高,尤其是60DAF和90DAF的种子中,相对于根的表达量为35.76,239.75倍;以大豆基因组DNA为模板,克隆PM40基因5′端上游启动子序列1 581 bp,生物信息学预测表明,PM40基因启动子序列中包含多种与种子高表达相关的顺式元件。推测大豆PM40基因启动子可能具有种子特异表达特性。
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【部分图文】:
本文编号:3922723
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图4pMD18-T-MP的双酶切鉴定结果
图3MP的PCR扩增产物图5MP启动子序列
图1大豆PM40基因在低温、盐、干旱和脱落酸条件下的表达
对大豆PM40基因在不同处理条件下进行表达分析,该基因在干旱(PEG)、盐(NaCl)、低温(4℃)和脱落酸条件下,处理不同时间,qRT-PCR检测结果表明(图1):在盐处理条件下,处理2h时PM40基因表达升高,是未处理的3.29倍,其余处理时间基因表达与未处理相比下降,说....
图2大豆PM40基因在大豆根、茎、叶、花和不同时期种子中的表达
对大豆PM40基因在大豆各组织中的表达进行分析,qRT-PCR检测结果表明(图2):大豆PM40基因在大豆种子中的表达相对较高,在叶、花中表达量低,相对于根中的表达量,该基因在叶、花中的相对表达量为0.16和0.58,在茎、30DAF、60DAF和90DAF中的相对表达量为2.8....
图3MP的PCR扩增产物
MP启动子序列中存在多种与种子特异表达或胚高表达相关的顺式调控元件(表1),PM40基因在大豆种子中高表达,特别是随着种子成熟表达量增加,在成熟种子中的表达最高,PM40基因的这种组织表达方式,与其启动子中含有表1中不同的顺式作用元件有密切的关系。图4pMD18-T-MP的双酶....
本文编号:3922723
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