玉米XYLPs基因家族表达模式及其蛋白结构分析
发布时间:2024-04-23 04:10
通过生物信息学的方法对玉米木质形成素类阿拉伯半乳糖蛋白(xylogen-like arabinogalactan proteins,XYLPs)基因家族的表达模式和蛋白结构进行了分析。ZmXYLPs基因家族成员在染色体上的分布具有一定的偏好性。基因复制事件不仅在基因家族成员数量的扩张和进化中发挥重要作用,同时还可能引起基因表达部位的扩张。根据ZmXYLPs蛋白结构特点,可将其分为两大类。其中仅ZmXYLP10/13/14蛋白存在N连接的糖修饰位点,其余ZmXYLPs蛋白均为O连接糖修饰位点。结果显示,玉米ZmXYLPs的生物学功能可能与其糖基侧链有关,并且其作用并不局限于维管组织发生过程,可能也参与生殖发育过程。
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【部分图文】:
本文编号:3962596
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图1ZmXYLPs基因的染色体定位和基因复制关系
进一步对ZmXYLPs在37个玉米不同发育时期和不同组织中的表达模式进行了分析。结果表明,ZmXYLPs基因在玉米不同发育时期的组织和器官中的表达存在明显差异(图2、图3)。ZmXYLP1/3/5在所有组织中的表达量均很低(图2、图3)。而ZmXYLP7和ZmXYLP8则特异性的....
图2ZmXYLPs在营养生长时期的表达模式
图1ZmXYLPs基因的染色体定位和基因复制关系图3ZmXYLPs在生殖生长时期的表达模式
图3ZmXYLPs在生殖生长时期的表达模式
图2ZmXYLPs在营养生长时期的表达模式2.3ZmXYLPs蛋白结构分析
图4ZmXYLPs蛋白结构示意图
表1玉米XYLPs蛋白结构分析Table1ProteinstructureanalysisofmaizeXYLPs基因GeneN端信号肽N-terminalsignalpeptideN端信号肽切割位点N-terminalsignalpeptidecle....
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