细胞内microRNA参与的基因调控网络的随机动力学研究
发布时间:2024-04-25 22:37
生物分子间的相互作用及其规律的研究是现代分子生物学研究的一个重要领域。从分子生物实验出发,研究分子间相互作用机理的系统生物学,有助于人们认识许多复杂疾病、动植物的寿命、生命周期节律等重要生命现象的本质。系统生物学中关于基因调控网络重构和功能预测是具有挑战性的课题之一。MicroRNA(miRNA)作为真核生物中普遍存在的一类重要的非编码RNA,大量的生物学实验研究表明:miRNA转录后抑制靶基因表达功能,在生物发育、细胞衰老与凋亡、癌症发生及转移等方面都起到了重要的作用。因此,对具有miRNA调控的基因网络动力学进行研究,在实验和理论上都有重要意义。基于已有的关于细胞周期、肿瘤细胞EMT/MET过程中基因调控网络的研究,本文主要考虑miRNA的作用、生化噪声、相互作用时间延迟分别对这两个生物过程的影响,建立起了相应的非线性动力学。本文的主要研究结果如下:(1)考虑MiR-17-92对细胞周期中Rb-E2F基因调控网络的作用,改进了此网络构建起了由Rb-E2F-CycE基因回路、E2F基因自激活回路两个正反馈环、E2F-miR-17-92负反馈环、转录因子Myc直接上调miR-17-92...
【文章页数】:75 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
本文编号:3964336
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【部分图文】:
图1.1?DNA编码区介绍
有力的证实了基因(gene)的存在,并且明确了其化学本质是DNA。??DNA具有双螺旋的二级结构,并且如果把双链的DNA拆开成单链DNA来看,??可以发现往往是那些编码区域如图1.1才具有生物学功能,而在这些区域中通过具??有的不同功能又可以有以下的划分:??<?upstream....
图1.6miRNA合成及作用机制图
生机制和作用机理也越来越受到人们所重视,随着实验手段和科学技术的进步,人??们对miRNA在微观层次的认识有了进一步的发展。??如图1.6所示,miRNA基因通常是由RNA聚合酶II?(pol?II)和小部分RNA??聚合酶Pol?III在核内转录产生的。最初的产物pri-miR....
图1.7?MiRNA调控网络模体及其相关功能[M:
—k——??了?ransoipton?regi^tion??图1.6miRNA合成及作用机制图。??1.4.2?MiRNA作用机制??人们对miRNA作用机制的认识逐渐深刻,主要有:一般在哺乳动物中比较常??见的是miRNAs与靶mRNA不完全互补,此时miRNA在蛋白质翻译水平....
图3.3随生长因子S增加E2F和miR-17-92稳态的分岔图
变为0.08/hr。E2F浓度取对数,E2F浓度曲线始终呈“S”形,具有双稳态区域。miR-17-92的??分岔曲线也有一^双稳态区域。??如图3.3?(b)对miRNA动力学分析表明,该系统在一定范围的生长因子5■下??也表现出双稳特性。然而miRNA分岔曲线的形状会随着增加而....
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