基于转录组测序的棘头梅童鱼四个生殖发育相关基因研究

发布时间：2024-05-14 22:07

　　棘头梅童鱼(Collichthys lucidus)作为我国重要的小型、底栖经济鱼类,广泛分布于我国河口地区及沿海海域。棘头梅童鱼的肉质细腻,味道鲜美,终年可以捕获,深受沿海居民的喜爱。然而,棘头梅童鱼有限的种群规模和繁衍速率难以满足市场需求,现已出现过度捕捞和种群衰退的危险。课题组已对我国沿海地区棘头梅童鱼群体遗传结构进行了系统研究,并正在开展棘头梅童鱼规模化繁育技术攻关与研究工作。目前,棘头梅童鱼缺少转录组学及基因组学信息,对棘头梅童鱼细胞学与生殖学方面的研究尚未见报道。对棘头梅童鱼生殖细胞发育及相关调控机制的研究,不论对棘头梅童鱼遗传基础的深入系统研究,还是产业化开发都有很深远的意义。本研究基于Illumina HiSeq^TMM 500测序平台,对棘头梅童鱼成熟精巢和卵巢进行转录组测序,经de nove组装,得到与棘头梅童鱼生殖发育相关的基因及信号通路;通过克隆得到生殖细胞特异基因dnd、dmrt1、foxl2和vasa cDNA全长序列,并对它们的表达模式和功能进行分析研究;最后通过数据库预测参与棘头梅童鱼生殖发育调控的microRNA。本研究结果不仅可以...

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【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图1-1棘头梅童鱼外部形态

梅童鱼简介童鱼（Collichthyslucidus），俗称梅童，小金鳞，隶属硬hyes），鲈形目（Perciformes），石首鱼科（Sciaenidae），梅童鱼属型底栖经济鱼类[73,74]，短期洄游、喜栖息于低盐度温水水域[75分布于我国黄渤海、东海和南海水域，适温、....

图1-2技术路线

上海海洋大学硕士学位论文LRE验证vasa和dnd的3’非编码区对于PGCs具有保守的标记作用，是重要的生殖细胞标记基因。通过靶向调控基因数据库反向预测和microRNA保守性分析，初步筛选到6个性腺特异的microRNA，为探究性腺特异基因转录后水平调....

图2-1NR注释物种分布图

图2-1NR注释物种分布图Fig.2-1NRspeciesdistributionGO分类注释用于描述序列的功能，分为生物过程（Biologicalprocess）、细（Cellularcomponent）和分子功能（Molecularfunction）三个部....

图2-2GO分类注释结果图

图2-2GO分类注释结果图Fig.2-2GOanalysis随后，通过eggNOG蛋白质组分析，用于unigene的功能分类。48,042个(36.63%nigene被分成24类（图2-3）。最丰富的类别有：信号转导机制（9710，20.2%）般功能预测（96....

本文编号：3973478