2017—2018年常州市甲型H3N2流感病毒血凝素基因特征分析

发布时间：2024-06-11 00:28

　　目的了解2017—2018年江苏省常州地区H3N2流感病毒血凝素(hemagglutinin,HA)基因的流行特征和变异情况。方法收集2017年4月至2018年3月常州市流感监测哨点医院采集的流感样病例咽拭子标本,用实时荧光定量RT-PCR的方法检测流感病毒核酸,H3N2阳性标本进行病毒分离,获得毒株后进行HA基因扩增和测序。结果在2017年4月至2018年3月间共分离获得28株甲型H3N2流感病毒毒株,经基因测序后构建系统进化树,发现其全部属于Group3C.2a,与同期疫苗株A/Hong Kong/4801/2014类似。将常州市分离的甲型H3N2流感病毒株与A/Hong Kong/4801/2014疫苗株在HA氨基酸序列上进行差异分析,发现常州分离的流行毒株在HA抗原决定簇(A-E)区域,有10个氨基酸位点突变,在HA抗原的茎部区域有2个氨基酸位点突变。结论 2017年4月至2018年3月间常州市流行的H3N2流感病毒与同期疫苗株A/Hong Kong/4801/2014(group 3C.2a)分布在同一进化分枝上,呈现1个基因亚组为主流的流行趋势,但HA抗原决定簇有部分氨基酸...

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 材料
        1.1.1 标本来源
        1.1.2 主要试剂与仪器
    1.2 方法
        1.2.1 流感病毒核酸检测及分离培养
        1.2.2 H3N2流感病毒HA基因扩增及测序
        1.2.3 H3N2流感病毒HA基因系统进化树分析
        1.2.4 H3N2流感病毒氨基酸抗原表位分析
        1.2.5 HA蛋白糖基化位点预测分析
2 结 果
    2.1 HA基因进化分析
    2.2 甲型H3N2流感病毒HA蛋白抗原表位分析
    2.3 甲型H3N2流感病毒HA蛋白N-糖基化位点预测分析
3 讨 论



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