应用基因芯片技术筛选曲古菌素A诱导肺腺癌耐药细胞株A549/CDDP差异表达的凋亡基因

发布时间：2024-06-29 14:16

　　目的应用基因芯片技术筛选曲古菌素A(TSA)处理顺铂耐药肺癌细胞株A549/CDDP后的凋亡相关基因的表达变化,筛选TSA治疗顺铂耐药肺癌的靶分子。方法 TSA处理A549/CDDP细胞24h,以未经TSA处理的A549/CDDP细胞作为对照组,提取两组细胞总RNA并反转录为c DNA,采用Nimble Gen全基因组表达芯片检测基因表达情况,以Nimble Scan 2.5软件结合GO分析比较TSA处理组与对照组基因表达谱的变化,从差异表达基因中筛选出与凋亡和增殖相关的基因。结果与对照组相比,共筛选到TSA上调的凋亡相关基因85个以及下调的细胞增殖和生长相关基因43个。GO分析发现,这些基因的分子功能主要是调节细胞凋亡和细胞对化学刺激的抵抗作用,以及参与细胞生长、增殖、细胞生物质量维持等生物过程。TSA不仅激活了线粒体凋亡通路,而且激活了死亡受体相关凋亡通路,下调了与细胞耐药相关的基因BAG3和ABCC2。结论 TSA改变了A549/CDDP细胞中凋亡和增殖基因的表达,这些基因可能在TSA治疗顺铂耐药肺癌中发挥了重要作用。

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 材料和试剂
    1.2 方法
        1.2.1 细胞培养与处理
        1.2.2 总RNA的提取和反转录
        1.2.3 基因芯片杂交
        1.2.4 实时定量PCR验证
    1.3 统计学处理
2 结果
    2.1 荧光染色检测TSA诱导凋亡结果
    2.2 总RNA抽提结果
    2.3芯片检测结果
    2.4 实时定量PCR验证
    2.5 GO富集分析结果
3 讨论



本文编号：3997678