柑橘MAPK基因的生物信息及其响应溃疡病菌侵染的表达分析

发布时间：2024-06-29 21:19

　　为挖掘柑橘溃疡病抗性关键基因,对柑橘促分裂原活化蛋白激酶(MAPK)基因家族进行注释和功能域分析,明确了CsMPK1、CsMPK3、CsMPK4、CsMPK6和CsMPK19的组织表达特异性和在抗病品种‘金弹’(Fortunella japonica Swingle)和感病品种‘晚锦橙’(Citrus sinensis Osbeck)中受病原菌(Xanthomonas citri subsp.citri,Xcc)诱导的表达情况;并对CsMPK19进行了生物信息分析。共注释出12个柑橘MAPK基因家族成员,根据系统发育树将其分为3个亚类,均含有促分裂原活化蛋白激酶(Pkinase)功能结构域。其中CsMPK1、CsMPK3、CsMPK4-1和CsMPK6在果实中表达水平较高,CsMPK19在叶片中表达量相对较高。CsMPK1的表达在溃疡病抗(感)品种中均受病原菌强烈诱导,且在感病品种中上调的幅度高于抗病品种;CsMPK3和CsMPK6仅在感病品种中病原菌处理早期有较强烈的响应;CsMPK4-1和CsMPK4-2的表达在感病品种中受病原菌诱导上调,而在抗病品种中病原菌处理后低于水处理对照;...

【文章页数】：12 页

【部分图文】：

图1柑橘与拟南芥MPK的功能域分析

柑橘与拟南芥的MAPK基因家族相似性较高，根据系统发育关系，MAPK基因家族可分为3个类群（Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ）。对柑橘和拟南芥的MAPK基因家族的功能域进行分析，发现这些基因都有促分裂原活化蛋白激酶（Pkinase）功能结构域（图1）。2.2CsMPK的组织表达特异性分析

图2CsMPK在‘晚锦橙’不同组织的表达量

根据目前MAPK基因在抗病方面的相关研究结果，结合课题组前期的研究基础，推测CsMPK1(Cs3g25220）、CsMPK3(Cs8g17360）、CsMPK4-1(orange1.1t00403）、CsMPK4-2(Cs5g03160）、CsMPK6(orange1.1t02....

图3CsMPK受溃疡病菌诱导的表达量分析

对在抗病品种中受病原菌诱导上调幅度较大的CsMPK19(Cs5g13100.1）进行了生物信息分析。序列比对表明，CsMPK19位于甜橙的5号染色体，基因全长5137bp，其开放阅读框由10个外显子组成，序列总长度为1824bp，可编码607个氨基酸；ProtPar....

图4不同物种MPK的系统进化树

根据甜橙的CsMPK19蛋白序列，通过Phytozomev12.1数据库和TAIR数据库获得了多个物种的MPK蛋白序列，并用MEGA7.0软件与可可树（Theobromacacao;Thecc1EG032167t1）、木瓜（Caricapapaya;evm.TU.cont....

本文编号：3997906