大豆KUP/HAK/KT钾转运体基因家族的鉴定与表达分析

发布时间：2025-01-15 09:52

　　 该研究基于已公布的大豆基因组序列信息,对大豆KUP/HAK/KT钾转运体基因家族进行了全基因组鉴定,并对该家族成员的基因特征、蛋白结构、染色体定位、基因复制和表达模式等进行了全面分析,为进一步了解该家族基因的功能及培育钾高效大豆品种提供理论支撑。结果表明:（1）在大豆基因组中共鉴定30个KUP/HAK/KT基因（简写为GmHAK01^GmHAK30）,这些基因分布在大豆的15条染色体上,串联复制和片段复制可能导致了GmHAKs基因在大豆基因组中的扩增。（2）大豆GmHAKs蛋白间序列一致性很高,均具有12～14个跨膜区,且都定位于质膜上。（3）进化分析表明大豆GmHAKs可聚为4个进化簇ClusterⅠ^Ⅳ,其中ClusterⅡ的成员数目最多（16个）,ClusterⅣ的成员数目最少（1个）。（4）所有GmHAKs基因均包含内含子和外显子,其内含子数目在7～9个之间,且同一亚家族的GmHAKs基因大部分具有相似的内含子-外显子分布模式。（5）表达模式分析表明,大豆GmHAKs的表达大致可分为两类:一类是一些组织特异性表达的基因,包括了Cluste...

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【文章目录】：
1 材料和方法
    1.1 KUP/HAK/KT家族成员的鉴定
    1.2 序列分析
    1.3 进化树的构建
    1.4 基因结构示意图的绘制
    1.5 染色体定位和基因复制分析
    1.6 基因表达模式分析
2 结果与分析
    2.1 大豆KUP/HAK/KT钾转运体家族成员的鉴定
    2.2 大豆KUP/HAK/KT家族成员的蛋白序列分析
    2.3 大豆KUP/HAK/KT家族成员的进化分析
    2.4 大豆KUP/HAK/KT家族成员的基因结构分析
    2.5 大豆KUP/HAK/KT家族成员的染色体定位及复制
    2.6 大豆KUP/HAK/KT家族基因的表达模式分析
3 讨论



本文编号：4027229