小麦TaCHS基因的克

发布时间：2025-02-11 14:49

　　 为了明确小麦查尔酮合成酶(CHS)基因TaCHS的表达规律以及挖掘TaCHS的等位变异,克隆了小麦TaCHS基因,并对其序列特征、表达特性及其在不同品种之间的多态性进行了分析。生物信息学分析表明,TaCHS基因属于多基因家族,编码的蛋白质分子质量为43.15 ku,理论等电点为6.43,属于疏水稳定蛋白,定位于细胞质中。进化分析表明,小麦TaCHS蛋白与二穗短柄草亲缘关系最为密切。TaCHS基因在根、茎、叶、籽粒中均有表达,其中在茎中表达量最高;在灌浆期,籽粒中TaCHS的表达量呈现出先升高后下降再升高的变化趋势,且在花后14 d的表达量达到第一个峰值。通过对119份小麦品种的TaCHS序列分析,发现其在不同小麦品种间的保守性较强,共发现4种变异类型,TaCHS-A1a、TaCHS-A1b、TaCHS-A1c、TaCHS-A1d分别占85.72%,7.56%,3.36%,3.36%。综上,TaCHS-A1a类型为主要的变异类型,而不同小麦品种TaCHS基因在籽粒中的表达可能与类黄酮类物质积累有关。

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【部分图文】：

图1 TaCHS蛋白的跨膜结构域(A)、二级(B)和三级(C)结构预测

对TaCHS-A1a基因进行生物信息学分析,其DNA全长1283bp,由2个外显子和1个内含子组成,CDS序列全长1185bp,编码394个氨基酸,其蛋白质分子质量为43.15ku,理论等电点为6.43,分子式为C1907H3048N526O563S25,脂肪族氨基酸指....

图2 不同来源的CHS基因进化树和基因结构

表2不同物种CHS基因的信息Tab.2InformationonCHSgenesindifferentspecies物种Species基因ID号GeneID（EnsemblPlants）琴叶拟南芥Arabidopsislyratafgenes....

图3 TaCHS基因在小麦中的时空表达模式

在灌浆期,TaCHS基因的表达水平在扬麦10号和周麦98165的籽粒中均呈现出先升高后下降再升高的特点,在花后14d达到第一个峰值;且在整个灌浆期,扬麦10号籽粒中TaCHS的表达量均高于周麦98165,这表明扬麦10号籽粒中可能有较高的类黄酮积累(图3-B)。2.4TaCH....

图4 不同小麦品种TaCHS基因PCR扩增结果

对119份小麦品种的DNA样品进行扩增,经1.5%琼脂糖凝胶电泳检测(图4)后,将有明亮目的条带的样品测序。通过序列比对分析发现,不同小麦品种TaCHS基因在56个位点处存在单核苷酸突变,并在内含子区域存在小片段的Indel,但其编码的氨基酸序列基本一致,仅在6个位点处存在差异(....

本文编号：4033419