铃铛子AlPMT基因的克隆及表达分析
发布时间:2025-02-26 20:46
本研究意在为进一步研究铃铛子中AlPMT基因的生物学功能奠定基础。选用茄科已发表的PMT基因序列进行多重序列比对,并以此结果进行简并引物设计,经PCR扩增及测序后得到铃铛子中AlPMT基因的全长核苷酸序列。AlPMT基因全长为1 296 bp,共编码有339个氨基酸,预测Al PMT蛋白分子量为37.2 kD,等电点为5.73。系统进化分析显示Al PMT蛋白与颠茄、三分三的PMT蛋白有较高的亲缘关系。转录模式分析表明AlPMT基因在铃铛子的根、茎、叶中均有表达,但是在根中表达量较高,同时证明该研究克隆的AlPMT基因与铃铛子中托品烷类生物碱的合成密切相关。
【文章页数】:7 页
【文章目录】:
1 材料
2 方法
2.1 RNA的提取与cDNA的合成
2.2 AlPMT基因的克隆
2.3 AlPMT基因的生物信息学分析
2.4 AlPMT基因的组织表达谱分析
3 结果与分析
3.1 铃铛子AlPMT的克隆和序列特征分析
3.2 AlPMT基因编码蛋白的生物信息学分析
3.2.1 理化性质分析
3.2.2 AlPMT编码蛋白二级结构预测
3.2.3 AlPMT氨基酸序列与保守结构域分析
3.2.4 AlPMT编码的蛋白信号肽和亚细胞定位预测分析
3.2.5 AlPMT分子进化树的构建
3.3 AlPMT基因的组织表达和诱导表达分析
3.3.1 AlPMT基因的组织表达分析
3.3.2 AlPMT基因的诱导表达分析
4 讨论
5 结论
本文编号:4034360
【文章页数】:7 页
【文章目录】:
1 材料
2 方法
2.1 RNA的提取与cDNA的合成
2.2 AlPMT基因的克隆
2.3 AlPMT基因的生物信息学分析
2.4 AlPMT基因的组织表达谱分析
3 结果与分析
3.1 铃铛子AlPMT的克隆和序列特征分析
3.2 AlPMT基因编码蛋白的生物信息学分析
3.2.1 理化性质分析
3.2.2 AlPMT编码蛋白二级结构预测
3.2.3 AlPMT氨基酸序列与保守结构域分析
3.2.4 AlPMT编码的蛋白信号肽和亚细胞定位预测分析
3.2.5 AlPMT分子进化树的构建
3.3 AlPMT基因的组织表达和诱导表达分析
3.3.1 AlPMT基因的组织表达分析
3.3.2 AlPMT基因的诱导表达分析
4 讨论
5 结论
本文编号:4034360
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