泥蚶HDAC1基因cDNA全长、内含子克隆及时空表达特征分析

发布时间：2017-06-14 21:12

  本文关键词：泥蚶HDAC1基因cDNA全长、内含子克隆及时空表达特征分析，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：HDAC1作为HDACs家族中重要成员,可使组蛋白去乙酰化进而调节基因表达,在细胞分化和胚胎早期发育中起重要作用。本文利用SMART RACE技术克隆得到泥蚶HDAC1(Tg-HDAC1)基因的cDNA全长序列,并对其内含子进行扩增及不同组织、不同发育时期的定量表达。结果发现:TgHDAC1基因的cDNA序列全长为2 275bp,开放阅读框(ORF)1 587bp,编码528个氨基酸;TgHDAC1蛋白序列与斑马鱼、鸡、小鼠等的相似性都在80%以上,表明该蛋白氨基酸序列在物种进化过程中具有保守性;在Tg-HDAC1基因中扩增出13个内含子,均存在于开放阅读框中,且都遵循GT-AG原则;荧光定量PCR(qRT-PCR)分析结果显示,Tg-HDAC1基因在成体血液、内脏团、外套膜、鳃、斧足和闭壳肌6个组织中均有表达,而在足中的表达量最高,且与其余5组织中的表达量有极显著差异(P0.01),说明它对该组织生长具有重要作用。不同发育时期的表达差异结果表明,TgHDAC1基因在担轮幼虫期表达量最高,显著高于其他发育时期(P0.05)。
【作者单位】： 上海海洋大学水产与生命学院;浙江万里学院生物与环境学院浙江省水产种质资源高效利用技术研究重点实验室;
【关键词】： 泥蚶 组蛋白去乙酰化酶(HDAC) 基因克隆 内含子 表达分析
【基金】：国家现代贝类产业技术体系项目(CARS-48) 浙江省自然科学基金重点项目(LZ12C19001) 浙江省重大科技专项(2012C12907-4) 国家水产种质资源平台项目(2015DKA30470)
【分类号】：S917.4
【正文快照】：

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