利用SNP基因芯片技术进行小麦遗传图谱构建及重要农艺性状QTL分析

发布时间：2017-06-15 04:06

  本文关键词：利用SNP基因芯片技术进行小麦遗传图谱构建及重要农艺性状QTL分析，，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：小麦遗传图谱是进行小麦染色体分析和表型研究的遗传基础.构建高密度遗传图谱,针对小麦重要农艺性状进行初级定位,确定相关性状主效数量性状位点(Quantitative Trait Loci,QTL),有助于开发辅助选择的实用性标记,并为利用次级群体进行精细定位和基因挖掘奠定基础.本研究以H461×CN16的重组自交系(Recombinant Inbred Line,RIL)为作图群体,利用90k小麦SNP基因芯片技术,对包含188个家系的RIL群体(F7)进行多态性分析,构建高密度遗传图谱,并利用Map QTL5.0的多QTL模型(MQM),对旗叶长、穗粒数等8个重要农艺性状进行QTL定位分析.构建了包括43个连锁群的分子遗传图谱,成功连锁到除2D、5D、6D外的18条染色体.该图谱共含有6 573个多态性SNP标记,覆盖的遗传距离长2 647.02 c M,标记间平均距离仅为0.4 c M.A、B、D三个染色体组分别含有标记2 696、3 094和684个;覆盖染色长度分别为1 130.92 c M、1 164.82 c M和330.44 c M;分别建立19、18和5个连锁群.对8种重要田间农艺性状进行QTL分析,共检测到66个重要农艺性状QTL,其中包括26个主效QTL,包含未见报道的新位点7个.全部QTL分布于2A、4A、6A、2B、4B、5B、2D、4D、7D 9条染色体上,单个QTL可解释表型变异率7.4%-19.5%,其中62个QTL加性效应来自母本H461,其余来自父本CN16.以上结果为小麦重要农艺性状QTL精细定位打下了基础,也为分子标记辅助育种提供了参考.
【作者单位】： 四川农业大学小麦研究所;
【关键词】： 普通小麦 K基因芯片 QTL定位 农艺性状 SNP
【基金】：国家自然科学基金项目(31301317) 国家国际科技合作专项(2015DFA30600)资助~~
【分类号】：S512.1
【正文快照】： CLC S330.2+5构建小麦遗传图谱是进行小麦基因组分析和研究表型变异的基础之一,遗传图谱的实效性随图谱标记密度的增加而提高,高密度的遗传图谱可以用于QTL位点识别、比较作图、标记辅助育种、精细作图及图位克隆.R?der等(1998)构建了第一张小麦SSR遗传图谱[1],涵盖了279个SSR

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本文编号：451385