基于p73和DAPK基因异常甲基化模式的白血病肿瘤标志物研究

发布时间：2017-06-19 19:12

  本文关键词：基于p73和DAPK基因异常甲基化模式的白血病肿瘤标志物研究，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：目的肿瘤抑制基因异常甲基化状态与白血病发生关系密切,发展白血病甲基化标志物成为研究热点。但白血病类型复杂,利用单个基因甲基化模式作为肿瘤标志物具有一定局限性。本研究通过探讨基于肿瘤抑制基因p73和死亡相关蛋白激酶(death-associated protein kinase gene,DAPK)异常甲基化模式对白血病诊断分型的价值和意义,寻找一种联合多基因异常甲基化模式作为白血病肿瘤标志物的方法。方法应用亚硫酸氢盐测序法(bisulfite sequencing PCR,BSP),分析正常人白细胞、单核细胞系白血病细胞株U937、粒细胞系HL-60及淋巴细胞系Jurkat基因组中,p73和DAPK基因启动子区CpG岛甲基化状态,将测序结果汇集到Office Excel 2010文件中,并计算各CpG位点甲基化率,绘制2个基因在4种细胞来源基因组中的CpG岛甲基化模式图,从而筛选特异甲基化位点组合。通过甲基化特异性PCR法(methylation specific PCR,MSP),在白血病细胞株、30例正常对照和104例白血病患者外周血标本中,验证基因异常甲基化模式的诊断效能。结果成功测序约107个含BSP产物转化质粒的菌株,并绘制出p73和DAPK基因CpG岛甲基化模式图。正常细胞基因组两者去甲基化程度远高于白血病细胞株。p73基因在正常细胞与白血病细胞株中,甲基化状态完全相反。DAPK基因在HL-60中与其他白血病细胞株甲基化状态存在明显差异。p73基因MSP甲基化检测可以鉴别正常细胞和白血病细胞,在临床白血病标本诊断中的灵敏度、特异度和准确度分别是21.5%、100.0%和43.1%,DAPK基因甲基化检测可以鉴别HL-60与其他白血病细胞株,其诊断急性非淋巴细胞白血病的灵敏度、特异度和准确性分别是59.1%、100.0%和77.2%。结论 p73和DAPK基因启动子区CpG岛在不同类型白血病细胞基因组中存在特异的甲基化位点,将其作为白血病初步诊断分型的潜在肿瘤标志物具有一定临床意义,也为今后发现白血病等肿瘤的甲基化标志物提供方法并奠定实验研究基础。
【作者单位】： 南阳理工学院张仲景国医学院;南阳市第一人民医院神经内科;中山大学达安基因股份有限公司科研部;
【关键词】： DAPK基因 白血病 肿瘤抑制基因 肿瘤标志物 DNA甲基化 表观遗传学
【分类号】：R733.7
【正文快照】： 中华肿瘤防治杂志,2016,23(11):716-721Chin J Cancer Prev Treat,2016,23(11):716-721白血病位居儿童及35岁成人恶性肿瘤发病率和死亡率首位[1]。研究发现,抑癌基因启动子区甲基化与白血病发生相关,通过检测其甲基化状态有助于肿瘤早期诊断[2]。抑癌基因p73能诱导细胞周期阻

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