香鳞毛蕨4CL基因密码子使用特性及表达预测分析

发布时间：2017-06-22 17:04

  本文关键词：香鳞毛蕨4CL基因密码子使用特性及表达预测分析，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：目的研究蕨类植物中4CL基因的表达与分析,为蕨类植物次级代谢产物的积累和调控奠定理论基础。方法运用CHIPS、CUSP和Codon W在线程序对自主克隆的香鳞毛蕨4CL基因(Df4CL)序列进行分析,并与大肠杆菌、酵母菌、拟南芥、烟草等基因进行比较,对了解Df4CL基因密码子使用特性,为其选择合适的表达系统具有重要意义。结果 Df4CL基因对ATGC选择没有偏向性,并且与小立碗藓的密码子使用偏好性相一致。在密码子使用频率上,Df4CL基因与拟南芥的差异小于与烟草、大肠杆菌、酵母的差异;基于4CL基因的密码子使用偏性的系统聚类分析表明,香鳞毛蕨与小立碗藓、拟南芥聚为一类。结论预示Df4CL基因更适合在拟南芥中外源表达。
【作者单位】： 东北农业大学生命科学学院;齐齐哈尔大学生命科学与农林学院;
【关键词】： 香鳞毛蕨 -香豆酸辅酶A连接酶 密码子使用特性 基因表达
【基金】：国家自然科学基金资助项目(31070291) 齐齐哈尔市科学技术项目(NYGG-201206-4)
【分类号】：S567.239
【正文快照】： 李珊珊1,2,陈玲玲1,王鹤萌1,胡宝忠1*,常缨1*1.东北农业大学生命科学学院,黑龙江哈尔滨1500302.齐齐哈尔大学生命科学与农林学院,黑龙江齐齐哈尔161006香鳞毛蕨Dryopteris fragrans(L.)Schott是鳞毛蕨科(Dryopteridaceae)鳞毛蕨属Dryopteris Adans多年生蕨类植物,其作为民间用

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本文编号：472460