河南某工厂附近农田土壤中抗生素抗性基因与可移动遗传元件的分布

发布时间：2017-06-30 11:04

  本文关键词：河南某工厂附近农田土壤中抗生素抗性基因与可移动遗传元件的分布，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：目的:观察河南某工厂附近农田土壤中抗生素抗性基因和可移动遗传元件的分布。方法:分别于不同时间点采集河南某工厂主导风向下风向上距离为700~2 500 m不等的7块农田土壤的土样,提取总DNA,采用PCR法检测15种抗生素抗性基因(包括四环素类药物抗性基因tet A、tet C、tet E、tet M、tet Q、tet W,磺胺类药物抗性基因sulⅠ、sulⅡ,β内酰胺类药物抗性基因bla-TEM、SHV、CTX-M-1,喹诺酮类药物的抗性基因qnr A、qnr B、qnr S,链霉素类药物抗性基因str A)和4种可移动遗传元件(包括整合酶基因int I1、int I2,插入序列共同区基因orf513、ISCR2),PCR阳性产物送测序,通过BLAST与Gen Bank数据库进行同源性比对。结果:共检出8种抗生素抗性基因,分别是sulⅡ、tet C、bla-TEM、sulⅠ、tet A、str A、tet M和tet W;3种可移动遗传元件int I1、int I2、ISCR2。各PCR扩增阳性产物经测序比对后,与Gen Bank已有序列识别度为95%~100%。各基因在不同距离土样中的阳性率比较差异均无统计学意义(P0.05),sulⅡ、tet C、bla-TEM和int I1在不同时间点的土样中阳性率比较差异有统计学意义(P0.05)。结论:该工厂附近农田土壤中常见抗生素抗性基因及可移动基因元件为sulⅡ、tet C、bla-TEM、sulⅠ和int I1,除sulⅠ外,sulⅡ、tet C、bla-TEM和int I1的分布均具有时间差异,但在不同距离农田土壤中分布稳定。
【作者单位】： 郑州大学公共卫生学院环境卫生学教研室;济源市重金属监测与污染治理重点实验室;
【关键词】： 农田土壤 抗生素抗性基因 可移动遗传元件 河南省 水平基因转移
【基金】：国家自然科学基金青年科学基金资助项目81202174
【分类号】：X53
【正文快照】： 178[12]BUTLER JM,DECKER AE,VALLONE PM,et al.Allelefrequencies for 27 Y-STR loci with U.S.Caucasian,Afri-can American,and Hispanic samples[J].Forensic SciInt,2006,156(2/3):250[13]BURGARELLA C,NAVASCU姣S M.Mutation rate esti-mates for 110 Y-chromosome STRs

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