陆地棉CAD基因家族的进化和表达分析

发布时间：2017-06-30 14:12

  本文关键词：陆地棉CAD基因家族的进化和表达分析，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：【目的】对陆地棉CAD基因家族成员进行进化和表达分析,了解其在棉纤维发育中的作用。【方法】应用生物信息学方法,从棉花基因组中筛选出21个CAD基因,并对CAD的基因结构、染色体分布、基因倍增模式以及系统进化进行分析。利用深度表达数据分析CAD基因在棉纤维发育各时期的表达。对比观察拟南芥cad5突变体和野生型根毛表型。【结果】同源性高的CAD基因复制对之间有相似的基因结构;片段重复和串联重复是CAD基因扩增的主要方式。进化分析可知,CAD基因可分为七个亚组,且功能相近的基因聚类在相同亚组。利用深度测序表达数据分析可知,CAD基因在棉纤维各个发育时期均有表达。对比拟南芥cad5突变体和野生型根毛发现,突变体相比于野生型有更长的根毛。【结论】CAD基因参与了棉纤维的发育的过程,并对棉花纤维发育起到一定的调控作用。
【作者单位】： 新疆师范大学生命科学学院;新疆农业科学院核技术生物技术研究所;
【关键词】： 棉纤维 CAD基因家族 系统进化分析 表达分析 cad突变体 根毛
【基金】：新疆维吾尔自治区高技术项目“棉花纤维品质分子改良技术创新研究”(201111116) 国家自然科学基金项目“棉花Gh CAD6基因在棉花纤维发育中的功能及调控机制”(31460386)~~
【分类号】：S562
【正文快照】： 0引言【研究意义】棉花是一种重要的经济作物,在全球100多个国家广泛种植,由它生产的棉纤维是全球重要的纺织原料之一,具有极其重要的经济价值[1]。陆地棉(Gossypium hirsutum)是栽培面积及经济效益最大的栽培棉种,它贡献了超过90%的棉花产量。此外棉花还是研究染色体加倍,细

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2 黄海燕;王玉富;薛召东;邱财生;郝冬梅;;亚麻CAD基因克隆及序列分析[J];湖北农业科学;2008年05期

3 ;[J];;年期

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本文编号：502206