人巨细胞病毒无症状性感染者UL144基因多态性研究

发布时间：2017-07-01 14:17

  本文关键词：人巨细胞病毒无症状性感染者UL144基因多态性研究，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：为探究人巨细胞病毒(HCMV)无症状性感染者UL144基因多态性,本研究采用聚合酶链反应扩增HCMVDNA阳性无症状性感染者尿沉渣标本UL144基因开放读码框(ORF),阳性结果进行双向DNA测序,通过生物信息学工具BioEdit、DNAstar、Mega5.0、GeneDoc等软件进行序列特征分析。结果显示,在50例HCMV-DNA阳性无症状性感染者尿沉渣标本中,21例标本UL144基因扩增阳性,阳性率为42%,并完成测序。同源性比较显示核苷酸同源性为80.2%~100%,氨基酸同源性为77.8%~100%。种系进化树分析显示21例无症状性感染者DNA序列主要分为2个基因型,A型(10例,47.61%)和B型(11例,52.38%),未见其他基因型。Expasy数据库预测分析UL144基因编码产物重要功能基团,结果显示ASN、PKC、TNFR、NCD3G等翻译后修饰位点高度保守。与UL144A型相比,UL144B型在1-16和30-96氨基酸残基之间各增加了一个PROKAR_LIPOPROTEIN位点和ZF_CTCHY位点。与Toledo标准病毒株比较,UL144A型的CRD1和CRD2区域高度保守,UL144B型的CRD1和CRD2功能区变异较大,但跨膜区(transmembrane domain)和胞浆区(cytoplasmic domain)在UL144A型和B型中均高度保守。UL144A型和B型碱基变异未对UL144蛋白的预测等电点和二级结构造成较大改变。总之与HCMV显性感染者不同,HCMV无症状性感染者UL144基因型为A型和B型。
【作者单位】： 温州医科大学微生物学和免疫学教研室;温州医科大学第二临床医学院;温州医科大学附属第一医院胃肠外科;温州医科大学附属第二医院检验科;
【关键词】： 人巨细胞病毒(HCMV) 无症状性感染 UL 多态性
【基金】：国家自然科学基金(项目号:81472308) 温州市科技局项目(项目号:Y20170744) 浙江省大学生新苗计划(项目号:2014R413058;2015R413069)
【分类号】：R440
【正文快照】： 人巨细胞病毒(Human cytomegalovirus,HC-MV)属于疱疹病毒科β亚科,基因组全长230-240kb,含有200多个可能的开放阅读框(ORF)[1]。该病毒在人群中感染非常普遍,大多数呈无症状性感染或潜伏感染[2]。但对于免疫低下或免疫缺陷个体(包括HIV感染、器官移植、骨髓移植患者)可引起不

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本文编号：506256