棉花EPSPS基因一个可变剪接体的克隆及功能分析
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【摘要】:可变剪接是生物体基因在转录过程中存在的普遍现象,该现象是导致蛋白质功能多样性的重要原因之一,但是在棉花中关于功能基因可变剪接事件的报到相对较少。本文在克隆棉花EPSPS(5-enolpyruvylshikimate 3-phosphate synthase)基因的过程中,发现了该基因的一条可变剪接序列。运用生物信息学的方法研究发现,该序列比正常的EPSPS基因的c DNA序列少152 bp,这造成了终止密码子在该序列的提前出现;正常的EPSPS基因内含子的剪切都遵循常见的"GT-AG"剪切规律,而该可变剪接序列最后一个内含子的剪切是按照"AT-AC"规则进行;该可变剪接序列预测的三维结构模型同正常的EPSPS基因的三维结构存在显著差异。将该可变剪接序列插入到原核表达载体p ET32a,随后将构建好的原核表达重组载体转化入大肠杆菌菌株BL21(DE3)Δaro A,通过在M9基本培养基中的生长研究发现该可变剪接序列不具备正常EPSPS基因所具有的功能。本研究结果丰富了棉花EPSPS基因转录本存在的形式,为深入研究棉花EPSPS基因的转录机制打下了基础。
【作者单位】: 江苏省农业科学院经济作物研究所/农业部长江下游棉花和油菜重点实验室;国家棉花工程技术研究中心;江苏沿江地区农业科学研究所;
【关键词】: 可变剪接 棉花 EPSPS基因 原核表达
【基金】:国家自然科学基金(31301682) 江苏省农业科技自主创新基金(CX(14)5009) 国家转基因重大专项(2013ZX08005) 国家科技支撑计划课题(2014BAD11B02)
【分类号】:S562
【正文快照】: 选择性剪接又称为可变剪接(Alternativesplicing),是指一个基因的转录产物在不同的生长发育阶段、特异的组织器官和外界环境影响下,通过不同的剪接方式,可以得到不同的m R-NA和蛋白质产物,这种现象是导致蛋白质功能多样性的重要原因之一[1]。可变剪接频率的认识随着研究技术的
【参考文献】
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