大麦ARF基因家族的全基因组分析

发布时间：2017-07-02 14:05

  本文关键词：大麦ARF基因家族的全基因组分析，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：生长素响应因子(auxin response factor,ARF)基因家族是植物特有的转录因子家族,在调控植物生长发育过程中起到重要作用。而关于大麦ARF基因家族全基因组分析的研究尚未见报道。为进一步探讨大麦ARF基因的功能,以公布的大麦栽培品种Morex的基因组数据为基础,采用生物信息学方法鉴定了大麦ARF基因,并对其结构、染色体分布、蛋白保守结构域、系统进化树及表达谱进行了分析。结果表明,共鉴定出了17个大麦ARF基因,除4号染色体外,其余6条染色体上均有分布,片段复制事件是大麦ARF基因家族的主要扩张方式;HvARF蛋白均具有保守的B3结构域和Auxin_resp结构域,而Aux/IAA结构域仅存在于12个HvARF蛋白中,且不同蛋白所含该结构域1~2个不等;不同植物中ARF基因在功能上具有保守性;不同组织器官中HvARF基因的表达存在明显的差异。
【作者单位】： 江苏省作物遗传生理国家重点实验室培育点/粮食作物现代产业技术协同创新中心/教育部植物功能基因组学重点实验室/扬州大学大麦研究所;
【关键词】： 大麦 生长素响应因子 进化树 表达谱
【基金】：国家自然科学基金项目(31401370;31571648) 国家大麦青稞产业技术体系建设专项(CARS-05) 江苏省农业科技自主创新基金项目(CX(14)2123) 江苏高校优势学科建设工程资助项目
【分类号】：S512.3
【正文快照】： 生长素响应因子(auxin response factor,ARF)基因家族是植物特有的转录因子家族,调控生长素响应的基因表达[1-3]。绝大多数的ARF蛋白具有3个保守的结构域,即N-末端B3DNA结合域(DNA-binding domain,DBD),具有DNA结合活性,能直接与生长素调控的下游基因启动子区的AuxREs结合;中

【相似文献】

中国硕士学位论文全文数据库 前1条

1 刘艳;玉米全基因组ARF基因的分析及进化研究[D];安徽农业大学;2011年

  本文关键词：大麦ARF基因家族的全基因组分析，由笔耕文化传播整理发布。

，

本文编号：510175