文蛤HDAC1基因克

发布时间：2017-07-07 19:14

  本文关键词：文蛤HDAC1基因克隆、时空表达及生长相关SNP位点筛查

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【摘要】：为探索HDAC1基因在文蛤生长发育中的作用,研究通过已构建的文蛤转录组文库,利用SMART RACE技术扩增得到文蛤HDAC1(Mm-HDAC1)基因的c DNA全长序列,分析了其生物信息学、组织及发育阶段表达特征,并用直接测序法在外显子中筛查生长相关的SNP位点。结果显示,Mm-HDAC1基因的c DNA全长3065 bp,开放阅读框1599 bp,编码532个氨基酸;氨基酸序列比对发现,文蛤与其他物种同源性为74.3%—78.7%。荧光定量PCR(q RT-PCR)结果表明,Mm-HDAC1基因在文蛤6个组织中均有表达,其中外套膜中的表达量相对最高,并与其他组织间有极显著差异(P0.01);不同发育时期的表达差异结果表明,MmHDAC1基因在壳顶幼虫期表达量最高,显著高于其他发育时期(P0.05)。SNP位点筛查结果表明,在MmHDAC1基因的外显子区域发现了19个SNP位点,其中有3个SNP位点(627AT、924TC和1266TC)与文蛤生长相关。
【作者单位】： 浙江万里学院浙江省水产种质资源高效利用技术研究重点实验室;
【关键词】： 文蛤 组蛋白去乙酰化酶 cDNA 荧光定量 SNP
【基金】：国家自然科学基金项目(31372527) 国家现代贝类产业技术体系项目(CARS-48) 浙江省重大科技专项(2012C12907-4) 国家水产种质资源平台项目(2015DKA30470)资助~~
【分类号】：S917.4
【正文快照】： 组蛋白去乙酰化酶1(Histone deacetylase 1,HDAC1)是HDACs家族中的重要一员,在卵母细胞成熟、胚胎发育、神经系统发生、骨骼分化、心脏发育、表皮分化、干细胞分化等过程中都发挥重要作用[1]。HDAC1是发现的第一个哺乳动物组蛋白脱乙酰化酶,推测其可能是基因转录的关键调节因

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本文编号：531466