白桦BpCesA基因的生物信息学及表达分析

发布时间：2017-07-19 10:16

  本文关键词：白桦BpCesA基因的生物信息学及表达分析

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【摘要】：从白桦45个转录组数据中分析获得6条白桦纤维素合成酶基因,其中2条为该家族的新基因,通过生物信息学及实时定量PCR技术探讨白桦Bp Ces A在不同材性白桦中的表达量情况。结果表明,6条白桦Bp Ces A基因的ORF长度在2 958~3 312 bp,编码的氨基酸数目在985~1 103 aa,相对分子量在110.40~124.29 k D,理论等电点为5.90~7.43;6条Bp Ces A均含有D,D,D,QXXRW保守结构域和8个跨膜螺旋,其中2个位于N端,6个位于C端。对来自6个双子叶植物,4个单子叶植物和1个裸子植物的52条Ces A进行了聚类分析发现:白桦Bp Ces A与同为木本的杨树Ptr Ces A具有较高的同源性,其中Bp Ces A2与Ptr Ces A3同源性达到92%、另外Bp Ces A5与Ptr Ces A6、Bp Ces A1与Ptr Ces A8也具有较高的同源性,分别为89%和82%。Bp Ces A1、Bp Ces A2、Bp Ces A3、Bp Ces A5基因随纤维素含量的增加,表达量也呈现增加趋势,推测这些基因在白桦的纤维素合成中起到促进的作用。本研究为揭示纤维素合成酶基因的功能分析提供了基础。
【作者单位】： 东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室;黑龙江省农业科学院经济作物研究所;
【关键词】： 白桦 纤维素 木质素 生物信息学 表达量
【基金】：“十二五”农村领域国家科技计划课题(2012BAD21B02) 东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室开放基金项目(201203)~~
【分类号】：S792.153
【正文快照】： 白桦(Betula platyphylla Suk.)属桦木科(Bet-ulaceae)桦木属(Betula),广泛分布于我国东北、华北、西北、西南等14个省区。白桦形态优美,树皮光滑洁白,有较高的观赏价值,适合作为城市绿化树种[1]。20世纪90年代初白桦被列为国家科技攻关研究对象之一,目前白桦作为国家科技支撑，

本文编号：562350