安吉小鲵MHCⅡ类基因及系统地理学研究

发布时间：2017-07-26 20:07

  本文关键词：安吉小鲵MHCⅡ类基因及系统地理学研究

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【摘要】：安吉小鲵(Hynobius amjiensis)是我国特有极度濒危物种,分布范围狭窄,种群数量稀少,面临着灭绝的危险。本研究选用MHC (Major histocompatibility complex)基因、细胞色素b(cytochrome b)、重组活化基因2(recombination activating gene)三种分子标记,对安吉小鲵的遗传多样性、遗传结构、系统发生关系、种群历史动态等进行研究,主要的成果如下：(1)安吉小鲵三个地理种群的遗传多样性水平低。基于MHC ⅡB数据、Cyt b数据、RAG2数据对浙江清凉峰(ZJQLF)种群、安徽清凉峰(AHQLF)种群、浙江省龙王山(LWS)种群的遗传多样性水平进行分析,表明安吉小鲵群体呈现出低水平的的遗传多样性,应加强保护管理。(2)空岛效应导致安吉小鲵群体分化程度大。基于Cyt b和RAG2基因整合数据的分析,ZJQLF种群、AHQLF种群、LWS种群间的交流不频繁,各个种群间遗传分化程度非常高。安吉小鲵仅分布于海拔高于1300m的泥炭藓湿地中,空岛效应导致处于不同山系的安吉小鲵种群交流受阻,为种群间的遗传分化提供了机会。(3)安吉小鲵种群曾发生过种群扩张。安徽清凉峰的气候可能受到第四纪冰期的影响,对安吉小鲵种群造成较大的影响。AHQLF种群位于安徽清凉峰腹部,受更新世末次冰期影响较大,具有明显的扩种群张过程。ZJQLF种群和LWS种群长时间相对稳定,未经历过扩张。(4)安吉小鲵三个地理种群被定义为两个进化显著单元。遵循保护遗传学的原理,本研究制定了两个安吉小鲵保护单元,即东部LWS种群为一个独立的进化显著单元,西部的ZJQLF种群与AHQLF种群作为一个大的进化显著单元。因此,安吉小鲵可作为东部和西部两个独立的管理单元开展保护工作。
【关键词】：安吉小鲵 MHCⅡB基因 细胞色素b 重组活化基因2 遗传多样性 分子系统地理学
【学位授予单位】：浙江师范大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：Q953;Q958
【目录】：

• 摘要3-5
• ABSTRACT5-9
• 第一章 综述9-24
• 1 安吉小鲵综述9-13
• 1.1 安吉小鲵生物学特征及其资源现状9-10
• 1.2 安吉小鲵研究现状10-13
• 2 两栖类MHC基因研究文献综述13-19
• 2.1 两栖类MHC的分类、组织分布13-14
• 2.2 两栖类MHC的结构特点14-16
• 2.3 MHC基因多态性维持机制16-18
• 2.4 MHC基因在保护遗传学中的应用18-19
• 3 系统地理学19-22
• 3.1 系统地理学简介19
• 3.2 分子系统地理学在两栖类中的应用19-20
• 3.3 分子标记的选用20-22
• 4 本研究论文的主要目的和意义22-24
• 第二章 MHCⅡB基因的克隆及多态性分析24-39
• 1. 引言24
• 2 材料与方法24-32
• 2.1 实验材料24-26
• 2.2 实验方法26-32
• 3 实验结果32-37
• 3.1 基因组总RNA的提取32
• 3.2 MHCⅡB基因exon2和exon3的克隆结果32-33
• 3.3 MHCⅡB基因exon2侧翼intronl序列的扩增结果33
• 3.4 安吉小鲵MHCⅡB exon2基因SSCP分析33-34
• 3.5 安吉小鲵MHCⅡB基因的序列变异分析34-36
• 3.6 选择作用检测结果36-37
• 3.7 重组检测37
• 4 讨论37-39
• 4.1 MHC基因的遗传多样性37-38
• 4.2 MHC基因多态性维持机制的分析38-39
• 第三章 安吉小鲵的系统地理学研究39-57
• 1. 引言39
• 2 材料和方法39-42
• 2.1 样本采集39-40
• 2.2 实验方法40-42
• 3 实验结果42-53
• 3.1 序列扩增及测序结果42-43
• 3.2 遗传多样性分析43-47
• 3.3 系统发育分析47-49
• 3.4 种群遗传结构分析49-51
• 3.5 群体历史动态分析51-53
• 4 讨论53-57
• 4.1 安吉小鲵的遗传多样性研究53-54
• 4.2 安吉小鲵的系统发育分析54
• 4.3 安吉小鲵的遗传结构研究54-55
• 4.4 安吉小鲵的种群动态研究55-56
• 4.5 保护启示56-57
• 第四章 结论57-59
• 参考文献59-69
• 攻读学位期间取得的研究成果发表文章69-70
• 致谢70-72

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前3条

1 温涛,谢锋,江建平,郑中华;中国有尾两栖动物的多样性保护及俗名探析[J];水利渔业;2005年02期

2 顾辉清,马小梅,王珏,杜振华,楼信权;安吉小鲵种群数量和数量动态的研究[J];四川动物;1999年03期

3 曾晓茂,费梁,叶昌媛,江建平;三种小鲵和极北鲵的核型[J];动物学研究;1997年03期

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本文编号：578092