基于RNA-Seq技术的苜蓿根蘖性状发生相关下调基因

发布时间：2017-08-01 04:08

  本文关键词：基于RNA-Seq技术的苜蓿根蘖性状发生相关下调基因

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【摘要】：为了从分子水平上分析苜蓿(Medicago sativa)根蘖性状的发生机制,对根蘖型苜蓿的根蘖与非根蘖根部进行RNA-seq转录组文库构建,并分析差异表达基因及其功能。分别提取品系"BL-101"的根蘖型苜蓿根蘖与非根蘖部位总RNA,利用磁珠法分离m RNA后通过PCR扩增构建RNA-Seq转录组文库,并对差异表达基因进行分析,得到差异表达基因15 978条,本研究重点分析下调基因,通过生物过程分类,发现与根蘖性状发生有关的表达下调的基因为5个,经生物学信息分析确定,其中2个属于Lon蛋白酶家族,其余分别属于植物肌动蛋白酶家族,硫氧还蛋白和脂氧合酶,其与植物抗逆性相关,且与植物激素ABA的调控有关。研究结果可以为探讨苜蓿根蘖性状发生的分子机制提供理论依据。
【作者单位】： 北京林业大学林学院;北京林业大学草地资源与生态研究中心;
【关键词】： 苜蓿 根系生长 生物信息学 脱落酸
【基金】：国家自然科学基金——基于RNA-seq技术的苜蓿根蘖性状发生分子机制研究(31201843) 北京林业大学校级大学生创新项目——基于RNA-seq技术的苜蓿根蘖性状发生分子机制的研究(X201410022009)
【分类号】：S541.9
【正文快照】： k遘俎，

本文编号：602409