结核分枝杆菌higB基因的扩增及生物信息学分析

发布时间：2017-08-02 09:35

  本文关键词：结核分枝杆菌higB基因的扩增及生物信息学分析

  更多相关文章： 结核分枝杆菌 higB 扩增 生物信息学分析

【摘要】：目的扩增结核分枝杆菌(H37Rv)的higB基因,运用生物信息学方法预测其编码蛋白的生物信息学特征。方法采用PCR方法扩增higB基因并对扩增产物测序,通过在线Protparam、protscale、SignaIP 4.1、MotifScan、SWISS_MODEL等程序,分析higB基因编码蛋白的生物学特征。结果获得的higB基因全长378bp,与预期大小基本一致,基因序列与GenBank上公布的MTB标准株的核苷酸同源性为100.00%。higB蛋白共125个氨基酸,分子质量单位为14.429 8ku,理论等电点10.18,脂溶性系数77.36,不稳定系数35.67,预测该蛋白为稳定蛋白。higB蛋白无信号肽,其二级结构中β-转角占12%,无规则卷曲占34.4%,氨基酸序列中有3个潜在的B细胞抗原表位,4个Th细胞表位,5个磷酸化位点。结论成功扩增了结核分枝杆菌higB基因,通过生物学信息获得了其编码蛋白的信息学特征,为研究该蛋白的生物学功能和免疫活性奠定了基础。
【作者单位】： 潍坊医学院医学检验学系;潍坊医学院临床学院病原生物学教研室;
【关键词】： 结核分枝杆菌 higB 扩增 生物信息学分析
【基金】：国家自然科学基金项目(No.81470001;No.81170080)
【分类号】：R440
【正文快照】： *?**?结核病是由结核分枝杆菌引起的慢性传染病。近年来,随着耐药株的不断增多,结核病已成为严重威胁人类健康的疾病。世界卫生组织(WHO)《2015年全球结核病报告》中2014年全球大约有960万人感染结核病,其中约120万人为结核病和艾滋病双重感染,5%的结核病患者为耐多药结核病(m

【相似文献】

中国重要会议论文全文数据库 前1条

1 陈玲;朱玲玲;史春梅;季晨博;郭锡熔;;miR-146b靶基因预测和生物信息学分析[A];2012年江浙沪儿科学术年会暨浙江省医学会儿科学分会学术年会、儿内科疾病诊治新进展国家级学习班论文汇编[C];2012年

，

本文编号：608652