芋头过氧化物酶基因克隆

发布时间：2017-08-07 16:01

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【摘要】：根据芋头的密码子使用频率,用i CODEHOP设计简并引物扩增芋头过氧化物酶基因序列,待芋头过氧化物酶基因非侧翼序列扩增成功后,依据其序列合成hiTAIL-PCR引物扩增芋头过氧化物酶基因的两侧序列。结果从芋头基因组DNA中克隆出1 165 bp序列,经同源性分析为过氧化物酶基因的部分序列;再利用hiTAIL-PCR技术可以扩增出芋头过氧化物酶基因的两侧序列,扩增序列为689 bp,测序结果能与1 165 bp序列拼接到一起,长1 854 bp。与已知的过氧化物酶进行序列比对,发现两侧还有氨基酸的编码序列,因此进行第2次hiTAIL-PCR,扩增出165 bp芋头过氧化物酶基因的侧翼序列,拼接后得到2 019bp。用Softberry上的基因预测软件分析后,发现包含过氧化物酶4个外显子,同源性分析表明,此过氧化物酶基因为含血红素的第三类过氧化物酶。
【作者单位】： 广东海洋大学农学院;
【关键词】： 芋头 过氧化物酶基因 hiTAIL-PCR 克隆
【基金】：国家公益性行业(农业)科研专项经费子课题分项目(200903017-08)
【分类号】：S632.3;Q943.2
【正文快照】： 芋头(Colocasia esculenta)主要种植于热带地区,在东南亚和太平洋地区是一种重要的经济作物。2016年国际粮农组织报告,2004—2014年期间,我国的芋头年均生产量居全球第在大多数情况下获得的主要产物片段为1~3kb[12]。hi TAIL-PCR技术非常实用[13-16]。例如,郭翠等[14]通过一次

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本文编号：635463