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《华中农业大学》2006年硕士论文

发布时间:2016-06-30 22:08

  本文关键词:枳抗逆基因的克隆及功能鉴定,由笔耕文化传播整理发布。


《华中农业大学》 2006年

枳PPF-1同源基因的克隆及表达特性分析

罗海澜  

【摘要】: 柑橘是我国的主栽果树之一。以枳(Poncirus trifoliata(L.)Raf.)为遗传资源培育抗性柑橘新种质是柑橘育种的主要内容之一。PPF-1是与开花、衰老及逆境有关的基因,本研究克隆了枳PPF-1同源基因PtPPF-1,并对其表达特性进行了分析。主要结果如下: 根据豌豆PPF-1、拟南芥ALBINO3的cDNA全长序列比对结果设计引物,通过RT-PCR及3′-RACE扩增得到了枳PPF-1同源基因的cDNA克隆片段(命名PtPPF-1),该基因全长1493bp,编码一条长452个氨基酸残基的多肽,理论分子量为125.1kD,等电点为4.92。经蛋白结构预测发现其含有一个长为36个氨基酸残基的叶绿体定位信号域和五个跨膜结构域。氨基酸序列比对表明,,PtPPF-1与豌豆PPF-1、拟南芥ALBINO3、水稻PPF-1相似性较高,与衣藻ALB3.2、性原细胞ALB3-1、绿领鞭藻类ALBINO3等同源蛋白相似性相对较低。 系统发育分析表明,PtPPF-1与豌豆PPF-1亲缘关系最近,其次为拟南芥ALBINO3和水稻PPF-1,四者同属一小族,说明PPF-1基因在进化过程中可能变异较小。 采用半定量RT-PCR对PtPPF-1的表达特性进行了分析。结果表明,PtPPF-1的表达量在枳叶片中最高,顶芽中次之,再次为茎,在根中没有检测到表达;而其红橘(Citrus tangerine Hort.ex Tanaka)的PPF-1同源基因在顶芽、叶片和茎中的表达没有差别。说明PtPPF-1的表达不仅具有组织特异性,而且种属间也存在差异。这可能与PtPPF-1基因含有叶绿体定位信号肽有关及枳抗性有关。 对不同植物生长调节剂处理枳叶中PtPPF-1表达情况进行了分析,结果表明GA_3、IAA、ABA促进了PtPPF-1的表达,KT对PtPPF-1的表达有抑制作用。推测GA_3、IAA、ABA信号通路可能与KT信号通路作用于PtPPF-1的表达存在不同的机制。PtPPF-1可能作为植物生长调节剂信号因子的一个下游信号元件存在,参与信号传导。 采用半定量RT-PCR对非生物胁迫(低温、干旱、盐)下枳的生理指标及PtPPF-1的表达情况进行了分析。结果表明,这三种胁迫都能诱导PtPPF-1的表达。说明PtPPF-1基因能响应这三种胁迫。SOD、POD活性在三种胁迫中均较高,CAT活性在三种胁迫中处于低水平;脯氨酸含量在三种胁迫中均表现为持续上升。三种胁迫中尤其是低温胁迫SOD、POD活性及脯氨酸含量的变化趋势与PtPPF-1的表达有很大的相似性,推测PtPPF-1基因可能与SOD、POD及脯氨酸之间存在一定的联系,并可以作为逆境胁迫标志物。

【关键词】:
【学位授予单位】:华中农业大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2006
【分类号】:S666
【目录】:

  • 缩略词表5-6
  • 摘要6-7
  • Abstracts7-9
  • 1 前言9-21
  • 1.1 问题的提出9-10
  • 1.2 前人研究进展10-20
  • 1.2.1 植物低温、干旱与盐胁迫研究现状10-12
  • 1.2.2 柑橘低温、干旱和盐胁迫研究进展12-16
  • 1.2.3 PPF-1基因的研究现状16-17
  • 1.2.4 植物基因克隆方法17-20
  • 1.3 研究内容、目的与意义20-21
  • 2 材料与方法21-28
  • 2.1 材料与试剂21-22
  • 2.1.1 材料21-22
  • 2.2 试验方法22-28
  • 2.2.1 总RNA的提取22-23
  • 2.2.2 总RNA定量与完整性检测23
  • 2.2.3 cDNA第一链的合成23
  • 2.2.4 PCR扩增条件23-25
  • 2.2.5 目的片段的回收25
  • 2.2.6 目的片段与载体连接25
  • 2.2.7 CaCl_2法制备感受态细胞25
  • 2.2.8 目的片段的转化及克隆鉴定25-26
  • 2.2.9 PtPPF-1在枳和红橘各组织中表达情况分析26
  • 2.2.10 不同植物生长调节剂处理对枳叶中PtPPF-1表达情况分析26
  • 2.2.11 低温、干旱、盐处理对枳叶片生理指标的影响及PtPPF-1表达情况析26
  • 2.2.12 序列测定26
  • 2.2.13 生物信息学分析26-28
  • 3 结果与分析28-42
  • 3.1 PtPPF-1的克隆28-29
  • 3.1.1 PtPPF-1中间编码区的扩增28
  • 3.1.2 PtPPF-1 3′ cDNA末端的扩增28
  • 3.1.3 PtPPF-1 5′ cDNA末端的扩增28-29
  • 3.1.4 PtPPF-1 cDNA全长的扩增29
  • 3.2 PtPPF-1的核酸序列分析29-31
  • 3.3 PtPPF-1的蛋白质序列分析31-34
  • 3.4 PtPPF-1及其同源序列的结构域分析34-35
  • 3.5 PtPPF-1的系统发育分析35-36
  • 3.6 PtPPF-1在枳壳和红橘各组织中表达情况分析36-37
  • 3.7 不同植物生长调节剂处理对枳壳叶中PtPPF-1表达情况分析37
  • 3.8 低温、干旱、盐处理对枳叶片生理指标的影响及PtPPF-1表达情况分析37-42
  • 3.8.1 低温、干旱、盐处理对枳叶片SOD活性的影响38
  • 3.8.2 低温、干旱、盐处理对叶片POD活性的影响38-39
  • 3.8.3 低温、干旱、盐处理对叶片CAT活性的影响39
  • 3.8.4 低温、干旱、盐处理对叶片脯氨酸含量的影响39-40
  • 3.8.5 低温、干旱、盐处理对可溶性蛋白含量的影响40-41
  • 3.8.6 低温、干旱、盐处理对枳叶片中PtPPF-1的表达情况分析41-42
  • 4 小结与讨论42-45
  • 4.1 PtPPF-1氨基酸序列的特性42
  • 4.2 PtPPF-1在组织中的表达情况分析42
  • 4.3 GA_3、IAA、ABA及KT对PtPPF-1表达的影响42-43
  • 4.4 低温、干旱、盐处理对PtPPF-1表达及枳叶片生理指标的影响43-45
  • 4.4.1 低温、干旱、盐处理对枳叶片PtPPF-1表达的影响43
  • 4.4.2 低温、干旱、盐处理对枳叶片生理指标的影响43-45
  • 参考文献45-47
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    本文编号:64145

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