茯苓细胞色素P450还原酶基因的克隆与生物信息学分析

发布时间：2017-08-10 02:14

  本文关键词：茯苓细胞色素P450还原酶基因的克隆与生物信息学分析

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【摘要】：目的从茯苓Poria cocos中克隆出细胞色素P450还原酶(CPR)基因,并对其进行生物信息学分析。方法利用茯苓转录组注释信息,通过RACE扩增得到茯苓CPR基因(Pc CPR)全长,并PCR得到对应基因组DNA序列。通过生物信息学方法,对该基因编码蛋白的特征进行分析,I-TASSER模拟出蛋白三级结构,MEGA构建蛋白系统进化树。结果获得含有完整开放阅读框(ORF)的c DNA全长2 514 bp(Gen Bank号为KP768251),Pc CPR的基因组DNA 5 292bp(Gen Bank号为KP896487),含4个外显子、3个内含子。基因编码732个氨基酸的蛋白,相对分子质量81 147,等电点(p I)为5.39,为不稳定性亲水蛋白,非分泌蛋白,且不具有信号识别功能。蛋白定位于内质网上,第7~22位氨基酸为跨膜区;具有2个黄素结合的保守结构域,FAD、NADP的结合位点各自在蛋白三级结构空间上相邻近。同源性分析显示,Pc CPR与担子菌CPR的相似性明显高于子囊菌CPR。结论成功从茯苓中克隆得到Pc CPR基因,为进一步研究Pc CPR及相关代谢提供基础。
【作者单位】： 华中农业大学药用植物研究所;
【关键词】： 茯苓 细胞色素P还原酶 基因克隆 生物信息学分析 RACE
【基金】：国家“十二五”科技支撑计划项目(2011BAI06B03)
【分类号】：S567.32
【正文快照】： 细胞色素P450还原酶(EC 1.6.2.4,cytochromeP450 reductase,简称CPR或POR)是一种在许多代谢进程中必需的酶,主要参与细胞色素P450氧化酶系(cytochrome P450 oxidoreductase system,P450s)催化的初级及次级代谢反应,如萜类物质代谢、药物代谢、外源化合物代谢等[1-2]。在此氧化

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