基于转录组测序的石斛生物碱和人参皂苷生物合成相关基因的发掘、克隆及鉴定

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基于转录组测序的石斛生物碱和人参皂苷生物合成相关基因的发掘、克隆及鉴定

     论文目录

目录第1-7页

摘要第7-9页

Abstract第9-11页

缩略词表第11-13页

第一章 文献综述第13-38页

 第一节 药用植物转录组学的研究进展第13-21页

   ·转录组学的概念第13页

   ·药用植物转录组学的研究意义第13-14页

   ·转录组学的研究方法第14-15页

   ·高通量测序技术的发展及在药用植物转录组学研究中的应用第15-21页

 第二节 基于转录组学的药用植物次生代谢物生物合成途径研究进展第21-24页

   ·药用植物次生代谢物的生物合成途径第21-23页

   ·药用植物次生代谢物的获取途径第23-24页

   ·转录组学在药用植物次生代谢物生物合成途径中的应用第24页

 第三节 石斛属生物碱的研究进展第24-26页

   ·石斛生物碱的分类及其结构第25页

   ·石斛生物碱的含量第25-26页

   ·石斛生物碱的药理作用第26页

 第四节 人参属植物人参皂苷生物合成途径相关基因的研究进展第26-28页

   ·人参皂苷的生物合成途径及相关酶基因的研究第26-27页

   ·转录组学在人参皂苷生物合成途径中的应用第27-28页

 第五节 本研究的目的和意义第28-30页

   ·药用植物转录组研究的目的与意义第29页

   ·人参皂苷生物合成途径酶基因的克隆及分析的目的与意义第29-30页

 参考文献第30-38页

第二章 铁皮石斛转录组测序、石斛生物碱生物合成途径基因的发掘及分子标记的研究第38-74页

 第一节 研究背景第38-42页

 第二节 材料与方法第42-50页

   ·材料、试剂与方法第42页

   ·实验方法第42-50页

 第三节 结果与分析第50-69页

   ·RNA的提取和454转录组文库的构建第50-51页

   ·454测序和EST拼接第51-54页

   ·铁皮石斛茎转录组的功能注释与功能分类第54-57页

   ·铁皮石斛茎转录组的代谢途径分析第57-59页

   ·铁皮石斛生物碱生物合成和转运相关的候选基因第59-66页

   ·铁皮石斛茎转录组中SSR的分布特征第66-69页

 第四节 讨论第69-72页

   ·铁皮石斛转录组测序与功能注释第69-70页

   ·铁皮石斛生物碱合成相关基因的大量发掘与分析第70-71页

   ·铁皮石斛转录组中SSR位点的分布特征第71-72页

 参考文献第72-74页

第三章 人参转录组测序、人参皂苷生物合成途径基因的发掘、microRNAs和SSR分子标记的研究第74-96页

 第一节 研究背景第74-76页

 第二节 材料与方法第76-78页

   ·材料、试剂与仪器第76-77页

   ·实验方法第77-78页

 第三节 结果与分析第78-92页

   ·RNA的提取和454转录组文库的构建第78-80页

   ·454测序和ESTs拼接第80-81页

   ·人参皂苷生物合成途径中功能基因的注释和挖掘第81-87页

   ·人参根、茎、叶、花独立基因数目的比较和分类第87-88页

   ·人参中miRNA的预测第88-91页

   ·人参转录组中SSR的分布特征第91-92页

 第四节 讨论第92-94页

   ·四年生人参转录组文库的构建及与其他人参属植物转录组的比较第92-93页

   ·高通量测序对miRNA研究的推动第93-94页

   ·人参转录组中SSR位点的分布特性第94页

 参考文献第94-96页

第四章 三七中人参皂苷生物合成途径基因克隆、分析与表达第96-124页

 第一节 研究背景第96-97页

 第二节 材料与方法第97-106页

   ·实验材料第97页

   ·实验方法第97-106页

 第三节 结果与分析第106-120页

   ·三七甲羟戊酸激酶PnMVK1基因的克隆和生物信息学分析第106-111页

   ·三七糖基转移酶PnUGT02086和PnUGT13895基因的克隆、生物信息学分析和蛋白表达第111-120页

 第四节 讨论第120-121页

   ·生物信息学在功能基因分析上的运用第120页

   ·功能基因的组织特异性表达第120-121页

   ·糖基转移酶PnUGT02086和PnUGT13895的原核表达第121页

 参考文献第121-124页

附录第124-134页

致谢第134-135页

个人简历第135-136页

论文编号BS1935989，，这篇论文共136页
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