番茄WRKY基因家族的生物信息学分析

发布时间：2017-08-17 17:20

  本文关键词：番茄WRKY基因家族的生物信息学分析

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【摘要】：通过生物信息学的方法对番茄WRKY转录因子家族成员、理化性质、基因分类、染色体定位、系统进化关系和结构域序列保守性进行了预测。从番茄WRKY转录因子家族分类及进化结果显示,番茄Sl WRKY家族包含81个成员,按其WRKY结构域及锌指结构分为3族,第二族按其氨基酸顺序又可以分为5个亚族。染色体定位结果显示,除番茄的11号染色体没有WRKY转录因子,其他染色体上均有分布。基因结构分析表明,仅Sl WRKY19、Sl WRKY20家族成员不含内含子,其他成员都含有2~5个内含子。保守域分析表明,番茄WRKY结构域是高度保守的,仅有10个WRKYGQK发生了变异,占WRKY家族的10%。
【作者单位】： 东北农业大学园艺学院;
【关键词】： 番茄 WRKY 转录因子 基因家族 生物信息学
【基金】：国家科技支撑计划项目(2012BAD02B02-7) 黑龙江省杰出青年科学基金(JC201204)共同资助
【分类号】：S641.2
【正文快照】： Bioinformatics Analysis of WRKY Gene Family in TomatoZhang Hong Jiang Jingbing Xu Xiangyang Li Jingfu*College of Horticulture,Northeast Agricultural University,Harbin,150030*Corresponding author,Ljf_2005@126.comWRKY是植物中最大的一类转录因子家族,该家族蛋

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本文编号：690207